外泌体miR-210-3p促进大肠癌细胞侵袭作用的研究及其靶基因的生物信息学分析

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:masonma
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:外泌体可参与肿瘤细胞侵袭、转移和血管生成等生物学过程,而侵袭转移是大肠癌患者死亡的主要原因。研究表明肿瘤细胞分泌的外泌体能够携带miRNA到受体细胞中,调控受体细胞增殖、侵袭、转移等生物学功能。据报道miR-210-3p在肺癌、肾癌中表达上调,可调控乳腺癌的细胞增殖、迁移和侵袭,但大肠癌细胞来源的外泌体是否表达miR-210-3p以及其在大肠癌细胞侵袭转移中的作用未见报道。因此,本研究将探讨高转移性大肠癌细胞来源的外泌体miR-210-3p在细胞迁移和侵袭过程中的作用机制。研究方法:1、miR-210-3p对大肠癌细胞迁移、侵袭的影响:(1)采用dbDEMC和OncomiR数据库分析miR-210-3p在大肠癌组织中的表达及其对大肠癌患者预后的影响;(2)实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测不同转移潜能的大肠癌细胞中miR-210-3p的表达;(3)qRT-PCR检测转染miR-210-3p mimics、inhibitor后,SW480细胞内miR-210-3p的表达水平变化;Transwell迁移和侵袭实验检测转染miR-210-3p mimics、inhibitor后,SW480细胞迁移和侵袭能力的变化。2、外泌体的提取及表征:(1)采用超速离心方法提取高转移性大肠癌SW620细胞分泌的外泌体;(2)通过透射电镜技术对提取的外泌体进行形态学表征;(3)采用Western blot检测外泌体中标志性蛋白分子的表达情况,进行分子表征。3、外泌体来源的miR-210-3p对SW480细胞的作用:(1)qRT-PCR检测不同转移潜能的大肠癌细胞来源的外泌体中miR-210-3p的表达情况;(2)qRT-PCR检测与SW620细胞来源的外泌体孵育后,SW480细胞内miR-210-3p的表达情况;(3)Transwell迁移和侵袭实验检测外泌体来源的miR-210-3p对SW480细胞迁移、侵袭能力的影响。4,miR-210-3p靶基因的预测与生物信息学分析:(1)采用miRDB、TargetScan7.2、starBase和mi RPathDB数据库预测miR-210-3p靶基因;(2)利用DAVID数据库进行GO生物学注释及KEGG信号通路富集分析;(3)利用String数据库分析筛选关键靶基因;(4)通过GEPIA进行关键性靶基因的表达验证。结果:1、miR-210-3p促进大肠癌细胞迁移、侵袭:(1)dbDEMC数据库分析显示,大肠癌组织中miR-210-3p的表达量明显高于癌旁组织,转移大肠癌组织中miR-210-3p的表达量显著高于原发癌组织;OncomiR数据库分析显示,miR-210-3p高表达的患者生存时间显著短于miR-210-3p低表达的患者;(2)qRT-PCR结果显示,高转移性大肠癌细胞系Lo Vo、HCT-116中miR-210-3p表达显著高于低转移性细胞系SW480、CL187、HCT-8;(3)qRT-PCR结果显示转染miR-210-3p mimics后,SW480细胞内miR-210-3p的表达水平升高;转染miR-210-3p inhibitor后,SW480细胞内mi R-210-3p的表达水平降低。Transwell迁移和侵袭实验表明上调miR-210-3p明显增强大肠癌细胞SW480的迁移、侵袭能力;下调miR-210-3p的表达后SW480细胞迁移、侵袭能力则显著减弱,提示miR-210-3p可促进大肠癌SW480细胞的迁移和侵袭能力。2、外泌体的提取和表征:(1)透射电镜结果显示,外泌体呈典型的杯状结构,大小约为60nm;(2)Western blot结果显示,外泌体高表达标志性分子CD63、CD9、CD81。结果提示成功提取到肿瘤细胞分泌的外泌体。3、外泌体来源的miR-210-3p促进SW480细胞迁移和侵袭:(1)qRT-PCR分析不同转移潜能的大肠癌细胞系内miR-210-3p的表达差异,结果显示:高转移性大肠癌SW620细胞分泌的外泌体中miR-210-3p的相对表达水平最高,且显著高于低转移性大肠癌SW480细胞外泌体中miR-210-3p的表达;(2)qRT-PCR实验结果显示:在与SW620细胞来源的外泌体孵育后,SW480细胞内miR-210-3p的表达显著上调;与转染inhibitor的SW620细胞来源的外泌体孵育后,SW480细胞内miR-210-3p的相对表达水平显著降低,表明高转移性大肠癌SW620细胞来源的外泌体miR-210-3p可被递送至受体细胞SW480细胞内;(3)Transwell迁移和侵袭实验结果显示,SW620细胞外泌体来源的外泌体miR-210-3p可促进SW480细胞迁移、侵袭。4,mi R-210-3p靶基因的预测与生物信息学分析:(1)miRDB、TargetScan7.2、starBase和miRPathDB数据库共预测到3035个靶基因;(2)GO生物学分析显示:在生物功能方面,靶基因功能主要富集在细胞迁移、细胞黏附、血管生成等;细胞组分方面,主要富集在细胞核、胞浆、吞噬小泡中;分子功能方面,主要富集在转录因子活性、铁锌离子转运等;KEGG信号通路富集分析显示:靶基因主要涉及癌症通路、HIF信号通路、Rap1信号通路等多个迁移相关信号转导通路;(3)String数据库分析显示有25个关键靶基因所编码的蛋白质起关键作用;(4)GEPIA结果显示RGMA在大肠癌组织中的表达显著低于正常组织,且其与大肠癌患者的预后相关。结论:1,miR-210-3p在高转移性大肠癌细胞中高表达,并且过表达miR-210-3p能够促进大肠癌细胞的迁移、侵袭过程。2,大肠癌细胞分泌的外泌体可通过水平递送的方式将miR-210-3p运输至受体细胞内,并促进其迁移和侵袭。
其他文献
招商蛇口是具备145年历史的招商局集团旗下金融、物流、地产三大主流业务板块之一,是中央直管总部在香港的四大国有企业之一。招商蛇口在房地产住宅市场以及产业园区开发市场
糖尿病是全球性慢性代谢病的一种,近年来患病人数呈明显增多趋势,预计2030年全球患病总人数将达到4.38亿。2013年全球因糖尿病共造成510万人死亡,医疗支出多达5000亿美元。沙
目的本研究主要探讨不同脊髓节段的针刺干预对子宫运动的调节作用,以及针刺对支配子宫的相关神经电活动的影响。旨在通过动物实验阐释:针刺不同穴位调节子宫运动及感觉的效应
汉字是汉语学习的重点。通过正确的策略来学习汉字可以使学生更容易学习汉字。印尼学生在汉字学习过程中会出现无法识别汉字字义的问题,若学习者使用正确的学习策略,就能够更
近年来,随着科技与经济的迅速发展,人们的生活习惯发生了很大变化,脂质代谢相关疾病成为困扰人类健康的重要问题。非酒精性脂肪肝病(NAFLD)是具有代表性的代谢性生活习惯病,
目前,我们所面临的世界已经进入了移动互联的时代,世界发生着日新月异的变化,所有人好奇并惊叹于互联网时代超速的演进,整个世界在信息的交织中展现着勃勃生机。随着创新时代
黑麦(Secale cereale L.)是小麦(Triticum aeistvum L.)的近缘物种之一,具有丰富的遗传多样性,在小麦遗传育种改良方面具有重要贡献。小黑麦(Triticale)由小麦属(Triticum)与
猪伪狂犬病是由伪狂犬病毒(PRV)引起猪的一种繁殖障碍性疫病,近年生产上该病发生有病毒变异的报道。为了解四川地区伪狂犬病毒流行野毒株生物学特性,首先,本研究从四川地区发病
本论文发展了一类有机羧酸的新型活化剂:炔丙酸酯,通过活性酯中间体的原位形成,同时结合亲核取代反应(以胺、醇、硫醇、苯硼酸为亲核试剂),实现选择性切断羧酸C-O键,从而快速
Micro RNA(miRNA)是一类小的,长度约在18-25个碱基左右的非编码RNA,在动物体内,绝大多数的miRNAs通过与3’-UTR(非编码区)中的靶基因的互补区结合来抑制靶基因向蛋白的转化,