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生态系统服务功能是指生态系统与生态过程所形成及所维持的人类赖以生存的自然环境条件与效用。以自然保护区为代表的森林生态系统服务功能价值是当前生态经济学的研究热点。本文在阐述了生态系统服务功能的概念、内涵、分类体系、评估方法及其研究进展的基础上，以江西赣江源自然保护区为具体的研究区域，在实地考察调研、部门资料收集的基础上，运用市场价值法等方法分别对植被类型的生产有机物、保持土壤、涵养水源、调节气候、净化环境、生物多样性保育6项生态价值，以及保护区的旅游、农产品价值进行了货币化估算研究。同时，结合赣江源自然保护区森林资源状况和现行的管理，从生态补偿方式和资金来源途径等提出了相应的生态补偿策略。本文主要得出以下结论：（1）赣江源自然保护区生态系统服务功能总价值为94858万元。间接生态价值占总价值的99.15%。赣江源自然保护区的间接生态价值远大于社会经济价值。（2）通过计算，生产有机物、保育土壤、涵养水源、调节气候、净化环境和生物多样性保护功能的总价值量，分别为4911万元、11901万元、9952万元、36214万元、5386万元、24806万元。赣江源森林生态系统植被在固碳制氧、维持生物多样性和保持土壤等方面的重要作用，将为人类带来巨大的生态财富。（3）计算结果表明：保护区的阔叶林、针叶林、竹林对生态总价值贡献率较大，同时，比较保护区单位面积生态价值，发现阔叶林、竹林、混交林价值较高，因此，保护区内的阔叶林和竹林分布区是生态价值高值区。（4）基于保护区生态价值的估算结果，比较保护区森林补偿、提供生态服务的成本、发展机会损失成本确定了保护区生态补偿标准每年约为1.6亿元，提出了可以按照资金补偿、生态移民的方式，以征收生态补偿税费和政府财政转移支付为主要资金来源的补偿策略。