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21世纪知识经济蓬勃发展，科学技术对于促进经济社会全面、协调和可持续发展的作用日益凸显，已经成为影响一个国家综合国力和国际竞争力的决定性因素。财政科技投入作为公共财政的重要支出部分和全社会科技投入的重要力量，在弥补市场失灵、优化资源配置、带动和引导社会科技投入方面具有不可替代的作用。发达国家和新兴工业国家，普遍把增加财政科技投入、加快科技发展提升到国家战略层面。
我国已正式提出走自主创新道路、建设创新型国家的国家战略。理论和实证分析表明，我国财政科技投入对经济增长具有较为明显的促进作用，以论文和专利指标衡量的我国科技产出效益也较高。
尽管近年来我国科技活动规模不断扩大，R&D经费支出、财政科技拨款等绝对数量指标持续上升，但是相对强度指标(如财政科技拨款占财政支出、R&D经费支出点GDP)上升仍旧缓慢甚至停滞，同世界上发达国家和新兴工业国家相比明显偏低，这表明财政科技投入的稳定增长机制尚未真正形成。财政科技投入的结构也并非合理，存在着诸如基础研究投入比例过低、地区财政科技投入不平衡等问题。此外，我国财政科技资金管理过程中也存在着一系列问题，既有体制上的痼疾，也有项目执行和管理过程中的不足。这些问题严重制约我国财政科技投入的效益发挥，羁绊科技进步和自主创新的步伐。
本文立足于目前我国科技发展水平和所处阶段的基本国情，综合利用实证和理论分析方法，系统阐释了我国现阶段财政科技投入的规模、结构及体制和资金管理的现状及存在问题，通过比较分析，借鉴国际经验，提出优化我国财政科技投入结构、提高财政科技投入效益的建议。
全文共五章。第一章，绪论。介绍本课题的研究背景及意义，国内外研究现状，论文的研究方法及结构。第二章，我国财政科技投入的现状及存在问题分析。首先简要介绍我国目前的财政科技投入机制，在此基础上，通过翔实的数据分析和横纵向对比，揭示我国财政科技投入在规模、结构上的现状及存在的问题；并从资金管理体制存在弊端的角度佐证财政科技投入效率不高的原因。第二章，我国财政科技投入的经济效益分析。本章既着眼于宏观，从财政科技投入与GDP增长的关系，又立足于微观，从财政科技投入与部分具体科技产出指标之间的关系两个方面，来论证财政科技投入的经济效益。第四章，国外典型国家财政科技投入机制及对中国的启示。主要选取美、日、德、韩等具有典型代表性的发达国家及新兴工业国家，介绍其财政科技投入战略及具体做法。并从经验关系的角度，总结各国家在经济发展阶段财政科技投入的共性和发展方向。第五章，总结提出优化财政科技投入结构、提高财政科技投入效益的政策建议。一是建立财政科技投入稳定增长并适度超前的机制；二是调整财政科技投入方向和重点，优化投入结构；三是改善财政科技投入方式，完善财政科技投入经费管理制度。