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公立医院是医疗卫生体系的主体，公益性是其本质特征，它承担着全民的健康事业，在国家健康战略中发挥着重要作用，公立医院又好又快发展，是缓解医患矛盾，实现健康战略的保障。新医改方案要求公立医院要遵循公益性，强化财务监督及运行监督，把公立医院行政部门工作人员纳入绩效考核体系，工资分配要体现劳动价值。 本研究以鄂尔多斯市中心医院行政部门及其工作人员作为研究对象，以贯彻医改要求为导向，以鄂尔多斯市中心医院全面发展为目标，分析了现阶段医院在对行政部门绩效考核中存在的问题，如行政部门绩效考核意识淡薄、绩效考核体系不健全，政府对公立医院补偿机制不完善。并针对上述问题，分析了出现这些问题的原因，公立医院绩效考核体系一直以来淡化对行政部门的考核，导致行政工作人员考核意识淡薄，大多行政工作难以量化考核，工作效果没有规范标准鉴定，所以无法建立完善的绩效考核体系，政府部门对公立医院的投入比例低，造成政府补偿机制无法落到实处。 论文就现阶段鄂尔多斯市中心医院行政部门绩效考核中存在的问题提出改进建议。 本研究通过文献分析、数理统计、个案研究等方法对公立医院行政部门绩效考核问题进行研究，及时发现考核中存在的问题，并提出改进意见。