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凡纳滨对虾在我国海水养殖中占有非常重要的地位,也是我国甲壳动物养殖业的最主要品种。近些年,其养殖的面积和产量稳步上升,带动了当地经济的发展,但也存在着不少问题,尤其是对虾病毒性疾病的影响,给养殖户造成了巨大的经济损失,严重威胁养虾业的可持续发展,到目前为止仍无有效的防治药物和措施。对虾缺乏特异性免疫系统,主要由体内众多免疫因子参与抵御病害,本论文通过克隆凡纳滨对虾免疫相关的基因并初步进行分析,以期对凡纳滨对虾的病害防治有所帮助,同时为提高对虾自身的抗病能力提供新的思路。本研究利用SMART技术构建了凡纳滨对虾肝胰腺组织全长cDNA文库,其滴度为1.2×106pfu/mL,重组率为97%,LD-PCR扩增片段大小在0.2kb-3.5kb,且在1.Okb处存在一条较亮的带,所构文库总体质量较好,随即挑取阳性克隆进行测序,将获得的cDNA序列在GenBank数据库进行序列同源性比较,发现该全长文库中有Rab基因家族成员Rab5B。本研究克隆获得了凡纳滨对虾Rab5B和Rab6A基因的cDNA序列,两者的开放阅读框长度分别为378bp和442bp,编码126和147个氨基酸,经BLAST蛋白比对发现,两者都具有NTP酶超家族结构域,与其他Rab家族成员的结构相似,进一步对无特定病原凡纳滨对虾进行体外攻毒试验,结合半定量PCR,显示两者的表达没有明显的组织特异性,只在对虾免疫组织肝胰腺中表达量略高,但对比发现两者在感染IHHNV病毒的对虾组织中的表达量要明显高于在正常对虾组织中的表达量。通过3’RACE和5’RACE获得凡纳滨对虾Rab7基因的全长cDNA序列,长度为767bp,其开放阅读框为618bp,编码205个氨基酸,推算分子量约23.33kDa,理论等电点为5.85。5’端和3’端分别存在88bp和61bp的非翻译区,在线分析显示Rab7前体蛋白的主要结构域与已知的Rab蛋白家族基本一致,主要功能域在物种间的保守性较强,只是前体蛋白末端的氨基酸序列存在种间差异性。半定量PCR显示凡纳滨对虾Rab7基因在正常对虾组织中都表达且没有明显差异,而在感染IHHNV病毒的对虾中上调表达,且在抗病毒对虾中的表达量最高。