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多种圆环病毒在畜禽和鸟类中广泛流行,如猪圆环病毒(Porcine circo virus,PCV)、鸡传染性贫血病毒(Chicken infectious anemia virus,CIAV)、鹦鹉喙羽病病毒(Psittacine beak and feather disease virus,PBFDV)等。其中,CIAV能破坏原始血细胞,能引起骨髓脂肪变性,全身性淋巴组织萎缩,还能够引起雏鸡发生再生障碍性贫血,造成免疫抑制,继而容易与其他病毒、细菌或真菌混合感染;而鹦鹉喙羽病(PBFD)是鹦鹉目前最常见的疾病,能造成患病鹦鹉羽毛对称性萎缩、脱落或异常生长以及某些鹦鹉喙和爪的异常变形,最后因免疫力降低引发感染而死亡,对鹦鹉养殖业危害极其严重。在上述三种病原中,除猪圆环病毒疫苗在商品化猪群中广泛应用外,鸡传染性贫血病毒和鹦鹉喙羽病病毒尚未有弱毒疫苗在商品化鸡群或鹦鹉中使用,这为我们使用常规分子生物学技术对其进行检测提供了便利。因此,本研究分别建立了检测CIAV和PBFDV的核酸斑点杂交方法,并对鉴定为阳性的CIAV和PBFDV进行了全基因组测序和分析,以期为类似不同物种间同科相近病毒的通用型筛选检测提供借鉴模式并为相关病原分子变异提供参考数据。1.CIAV和PBFDV核酸斑点杂交检测方法的建立本研究分别设计了以地高辛标记的CIAV核酸探针和PBFDV核酸探针分别对疑似感染CIAV商品肉鸡病料和疑似感染PBFDV鹦鹉病料进行斑点杂交检测,同时分别应用针对CIAV和PBFDV的引物进行常规分子生物学PCR检测。结果显示核酸斑点杂交检测方法具有较高的灵敏性和良好的特异性,其检测结果与PCR检测结果高度一致。本研究为在我国开展CIAV和PBFDV感染的分子流行病学调查和临床诊断提供了一种敏感、特异的检测方法,为进一步了解CIAV和PBFDV奠定了基础。2.阳性样品中CIAV和PBFDV的全基因组测序及分析用本研究所建立的核酸斑点杂交检测方法对疑似感染CIAV商品肉鸡病料和疑似感染PBFDV鹦鹉病料进行斑点杂交检测,根据已发表的CIAV和PBFDV基因序列,分别设计合成了用于扩增两种病毒全基因组的引物,对鉴定为阳性的CIAV和PBFDV进行了全基因组扩增和测序,并对其进行同源性比较和遗传进化分析。结果表明,完成全基因组测序的5株CIAV序列之间同源性为97.5%-99.2%,而两个PBFDV序列之间其同源性更是高达100%,这进一步显示了感染家禽和鸟类的圆环病毒高度保守的分子特质。同时,本研究加深了对CIAV和PBFDV进化途径的了解,有助于进一步研究其流行病学特点和分子生物学特点,对于预防和控制CIAV和PBFDV的感染有重要意义。