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IRS蛋白是IR/IGF受体酪氨酸激酶的底物,是连接IR/IGF信号通路中上下游信号分子的重要介质,在调节机体的生长、发育中起到非常重要的作用。骨形态发生蛋白受体(BMPR),它可通过参与BMP-2, BMP-4, BMP-6, BMP-7, BMP-15和GDF-5的信号转导,从而在调节颗粒细胞分化、促进卵泡发育,增加卵泡数及促进骨骼生长中发挥着重要作用。本研究以家兔IRS-1和BMPR1B基因为候选基因,以新西兰、天府黑兔、艾格、香槟兔4个品种共785只肉兔(其中幼兔587只、能繁母兔198只)为实验研究对象,采用PCR产物直接测序的方法检测IRS-1和BMPR1B编码区SNPs位点,并应用RFLP及HRM技术对每个基因候选靶SNPs位点进行基因分型,分析每个靶SNPs位点不同基因型与家兔生产性能的相关性,同时利用荧光定量技术分析不同生长阶段新西兰兔肝脏组织及70日龄时C.189G>T位点不同基因型个体IRS-1基因表达量变化。获得的实验结果如下：1.经直接测序发现IRS-1基因编码区存在9个SNPs位点,分别为c.189G>T、 C.337C>T、c.1341C>T、c.2541T>A、c.2574G>A、c.2811C>T、c.3234G>A、 c.3508T>C和c.3636C>T,且9个突变位点均为同义突变。2.对IRS-1基因c.189G>T和c.2574G>A两个位点基因分型结果显示,在新西兰和天府黑兔中c.189G>T (GG、GT、TT)和c.2574G>A (GG、AG、AA)均检测到三种基因型,在艾格和香槟兔中c.189G>T (GG、GT)和c.2574G>A (GG、AG)只检测到两种基因型。遗传多态信息含量(PIC)分析表明两个候选靶位点在新西兰和天府黑兔中处于中度多态(0.25<PIC<0.5),在艾格和香槟兔中处于低度多肽(PIC<0.25)；卡方检验结果显示在4个家兔品种中两个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。3.对IRS-1基因c.189G>T和c.2574G>A位点与家兔生产性能关联性分析结果显示：IRS-1基因c.189G>T和c.2574G>A位点不同基因型个体之间均与新西兰兔56、70、84日龄个体重及35-84日龄平均日增重显著(P<0.05)或极显著相关(P<0.01)。对艾格、香槟、天府黑兔三个家兔品种混合群体合拼分析结果表明,c.189G>T位点GT基因个体84日龄体重、35-84日龄平均日增重及后腿肌肉pH24值显著高于GG基因型个体(P<0.05),其他性状在两种基因型之间差异不显著(P>0.05)；c.2574G>A位点GG基因型个体和GT基因型个体之间不同日龄体重、屠宰率、肌内脂肪含量等性状均无显著性关联(P>0.05)。4.单倍型分析结果显示：IRS-1基因c.189G>T和c.2574G>A位点共构建成四种单倍型h1 (GA)、h2(GG)、h3(TA)、h4(TG),在新西兰兔(N=280)中共检测到七种单倍型组合,分别h1h2(GGAG)、h1h3(GTAA)、h1h4(GTAG)、 h2h2(GGGG)、h2h4(GTGG)、h3h3(TTAA)、h3h4(TTAG);在艾格、香槟、天府黑兔三个品种共计214只肉兔中共检测到四种单倍型组合,分别为h1h2(GGAG)、 h1h4(GTAG) h2h2(GGGG)、h2h4(GTGG)。在新西兰兔群体中单倍型组合h3h3个体56、70、84日龄体重及35-84日龄平均日增重均显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)高于h1h2、h1h4、h2h2及h2h4组合。对艾格、香槟、天府黑兔三个家兔品种混合群体合拼分析结果表明,hlh4组合基因型个体84日龄体重、35-84日龄平均日增重显著高于其他三种组合,背最长肌肌内脂肪含量显著高于h2h2组合和h2h4组合,背最长肌pH24值、后腿肌肉pH24值显著高于hlh2组合(P<0.05)；h2h4组合后腿肌内脂肪含量显著高于hlh2组合(P<0.05)。5.家兔肝脏IRS-1基因表达量研究表明：56日龄肝脏组织IRS-1基因表达量显著高于35日龄(P<0.05)；70日龄时1RS-1基因c.189G>T位点GG基因型个体肝脏组织1RS-1基因表达量显著高于TT基因型个体(P<0.05)。6.经混合测序发现BMPR1B基因编码区存在13个同义SNPs位点(c.9C>T、c.54C>T、c.75T>A、c.88C>T、c.96T>C、c.117G>A、c.384A>G、c.540C>T、 c.6031>C、c.12541>A、c.1332A>G、c.1356A>G. c.1436A>G)和一个错义SNPs位点(leu 131 ser)。7.对BMPR1B基因c.117G>A位点基因分型结果显示,在新西兰和天府黑兔中该位点均存在GG、GA及AA三种基因型。遗传多态信息含量(PIC)分析表明c.117G>A位点在新西兰和天府黑兔两个品种中均处于中度多态(0.25<PIC<0.5)；卡方检验结果显示该位点在新西兰和天府黑兔两个品种中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。8. BMPR1B基因c.117G>A位点不同基因型与新西兰及天府黑兔能繁母兔繁殖性能关联性分析结果显示,AA基因型个体窝产仔数、活仔数、21日龄活仔数及21日龄窝重显著(P<0.05)或极显著(P<0.01)高于GG和GA基因型个体；c.117G>A位点不同基因型与新西兰幼兔生长速度关联性分析表明,AA基因型个体35日龄断奶重显著高于GG基因型个体(P<0.05)。