【摘 要】
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数字PCR是一种用于核酸分子绝对定量和罕见突变检测的有力方法,采用平行的,分离的PCR反应来扩增和定量核酸分子。传统的数字PCR芯片存在依赖外部控制设备、工艺复杂、样品蒸发等问题,不利于提高检测过程的稳定性、经济性以及高效性。因此,兼具制备工艺简单与精准定量检测的数字PCR芯片成为未来微型核酸定量设备的发展趋势。本文提出一种基于微通道板的数字PCR检测芯片,主要研究内容如下:(1)芯片设计与检测流
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数字PCR是一种用于核酸分子绝对定量和罕见突变检测的有力方法,采用平行的,分离的PCR反应来扩增和定量核酸分子。传统的数字PCR芯片存在依赖外部控制设备、工艺复杂、样品蒸发等问题,不利于提高检测过程的稳定性、经济性以及高效性。因此,兼具制备工艺简单与精准定量检测的数字PCR芯片成为未来微型核酸定量设备的发展趋势。本文提出一种基于微通道板的数字PCR检测芯片,主要研究内容如下:(1)芯片设计与检测流程,为了简化芯片制备工艺,采用微通道板作为PCR反应平台,传统微通道板是通过纤维拉伸工艺制作的玻璃通孔阵列,因其具有光电子倍增特性而广泛应用于影像增强和微光夜视。本文所制作的微通道板仅保留其阵列结构,微通道基底材料为玻璃,具有良好的荧光可视化特性与防蒸发性能,大大简化了传统数字PCR芯片需要集成纳米防水层的工艺复杂度。该芯片将微通道板切割并通过等离子键合技术单片集成于PDMS微流道中,利用PDMS材料气溶性完成自吸入进样,使用自固化硅油完成样品分隔与密封,该芯片单个微通道体积为0.1 n L,阵列密度为150000个/cm~2。(2)核酸分子定量检测,为了验证该芯片的绝对定量性能,使用该芯片对Lambda-DNA以及肺癌相关PLAU基因进行绝对定量检测,通过荧光显微镜采集微通道板的数字化分布结果并绘制线性拟合曲线,R~2分别为0.9998和0.9996,证明该芯片具有绝对定量能力。同时,将该芯片检测样品浓度与商用Nano Drop仪与QPCR仪检测同源样品浓度进行比较,检测结果具有高度一致性,证明该芯片绝对定量性能优异。使用该芯片对同源Lambda-DNA样品进行三次独立检测,检测结果标准偏差均小于10%,证明该芯片定量性能稳定,检测动态范围跨越5个数量级。(3)数字ELISA测试与荧光增强,为了验证该芯片是否能用于蛋白质定量,将该芯片结构改进后用于半乳糖苷酶的数字ELISA检测,建立200 fg/μL-40 fg/μL浓度范围内良好线性模型,R~2为0.987,检测极限为4 fg/μL。为了增强图像数字化结果,使用倾斜角沉积技术与阴影效应在微通道内壁生长金包裹银纳米棒来增强荧光信号,增大阳性与阴性微通道的信号差,减少假阳性或假阴性的误判。最后,该芯片不需要复杂的光刻或多层软光刻工艺,可以大规模低成本地制备,具备应用于临床诊疗产业化的潜力。
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