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本研究包括两方面的工作:纳升喷雾装置的研制及其在蛋白质组学中的应用和稳定同位素化学标记新方法的探讨.放置金属丝穿过玻璃喷头中是一种提供电接触的简单方法,为了克服使用细金属丝难于操作的局限,我们采用相对粗的金属丝并将玻璃喷头制作成一端带有很长的玻璃丝以减缓分析液的喷雾流速.这一改进的纳升喷雾头能长时间稳定喷雾,喷雾流速80-120 nL/min.纳升喷雾头有很好的检测灵敏度,30 min喷雾浓度为25 pg/μL利血平溶液其准分子离子峰的平均信噪比(S/N)为42.改进的纳升喷雾头可用于分析标准蛋白质溶液酶解及胶上酶解肽,消耗不足1微升样品便可实施蛋白鉴定;还可分析实际蛋白样品,选择了7个由两维凝胶电泳分离的人类U937细胞裂解液的蛋白质点,其鉴定结果明显好于相应的LC/MS鉴定结果.同时,我们探讨了在纳升喷雾过程中添加一辅助电极对纳升喷雾的影响,发现辅助电极的存在可显著改善纳升喷雾的信噪比,辅助电极存在下电场分布的模拟计算也支持了这一结果.基于金属丝提供电接触的纳升喷雾头最大缺陷是难于和其它设备在线连接,为了弥补这一不足,我们制作一种喷雾装置.此装置借助于不锈钢三通将玻璃喷头和金属丝有效的相连接,三通的其中一个入口作为气体通路,允许气体辅助样品装载.此装置通过石英毛细管可于其它设备在线连接.在此装置中金属丝无须穿过玻璃喷头,因而允许玻璃喷头保持极小的喷雾口径,这一安排使纳升喷雾有更低的分析液流速30-60 nL/min和更高的检测灵敏度,25 min喷雾浓度为25 pg/μL利血平溶液其准分子离子峰的平均信噪比(S/N)为179.浓度为1 ng/μL的肌红蛋白和细胞色素C溶液酶解肽可进行蛋白鉴定,浓度为5 ng/μL的细胞色素C可提供十分满意的纳升喷雾的质谱图.我们比较了酸性、中性和碱性介质中蛋白溶液酶解肽喷雾的差异,此外将喷雾装置与一注射泵连接用来监测有机化学反应的发生.稳定同位素化学标记新方法的探讨致力寻找简单、有效的同位素化学标记方法.我们改进了传统的氨基酸/肽季铵化方法,用碳酸银替代碳酸氢钾催化季铵化反应的发生.改进的季铵化反应以氨基酸/肽季铵化的季铵化酯化产物为主,反应体系中无大量金属离子,因而可用质谱现场检测反应产物.此外,我们制备一个具有很好选择性的乙酰化试剂.改进的季铵化反应及选择性的乙酰化试剂在定量蛋白质组学中的应用有待进一步研究.