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乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一，其发生率在多个国家和地区位居女性肿瘤第一位。目前研究认为乳腺癌的发生与环境、营养和基因等多种因素及其交互作用密切相关。然而，迄今所发现的遗传变异占总的乳腺癌发生遗传因素的比例不足35％。同时，影响乳腺癌发生的环境及营养因素也没有被完全认知。因此，开展对乳腺癌发生的病因学研究，发现显著影响乳腺癌发生和发展的遗传、营养和环境因素，能够为筛选出乳腺癌发生高危人群，进行有效的干预预防，从而达到降低乳腺癌发生率的目的。
PALB2基因是近年来新发现的乳腺癌抑癌基因，它参与了DNA损伤后染色体同源重组修复过程。前期研究发现PALB2的基因突变造成乳腺癌风险增加，然而，人群中PALB2基因突变频率很小。考虑到PALB2对保持基因组稳定性的重要生物学功能，PALB2基因上的遗传多态性位点(SNP)是否和乳腺癌发生风险相关值得探讨；FGFR2和TNRC9是近年来利用全基因组关联研究所发现的和欧美人群乳腺癌发生显著相关的基因，它们是否和中国人群乳腺癌发生风险相关不得而知，同时研究揭示FGFR2和TNRC9和雌激素信号通路的存在联系，它们的遗传变异是否对不同亚型的乳腺癌（如雌激素受体阳性和阴性）风险的影响是否相同也值得探讨；近年来研究揭示维生素D和钙具有抑制乳腺癌发生的作用，然而关于维生素D和钙的摄入水平对乳腺癌发生风险影响的人群研究结论不一致，难以确认维生素D和钙的摄入量的高低对乳腺癌发生风险的影响的大小和显著性。
在本论文的第一部分，我们对中国汉族女性人群中PALB2、FGFR2和TNRC9的基因遗传变异位点与乳腺癌发生风险关系进行了研究，结果表明：1）PALB2基因上3个SNP位点（rS249954、rs120963和rs16940342）与乳腺癌的发生相关，在显性遗传模型下，位点rs249954的变异显著增加乳腺癌风险36%(95%CI=1.13-1.64，p=0.001)，位点rS120963和乳腺癌发生风险显著相关(OR=1.25，95% CI=1.04-1.49，p=0.014)，位点rs16940342的变异造成乳腺癌发生风险增加大约21%（95% CI=1.02-1.45，p=0.037）；2）FGFR2基因上的3个遗传多态性位点rs2981582、fS1219648和rs2420946与乳腺癌的易感性相关，显性模型下含有上述3个危险位点的人群患有乳腺癌的发生风险是含有2个及以下人群的1.36倍(OR=1.36，95% CI=1.13-1.62，p=0.001)，分层研究发现上述关联在肿瘤组织雌激素受体( Estrogen Receptor，ER)和孕激素受体(ProgesteroneReceptor，PR)阳性人群中关联更强；3）TNRC9上的三个和欧美人群乳腺癌发生风险显著相关的位点rs3803662、rs12443621和rsS051542与我国乳腺癌发生易感性没有显著相关性，但rS12443621和ER阳性的乳腺癌病人发病易感性显著相关(OR=1.38，95% CI=1.01-1.88)。上述研究结果加深了对影响我国汉族女性人群的乳腺癌发生的遗传背景的认识，也初步显示影响我国乳腺癌发生的遗传因素和影响欧美人群的遗传因素之间可能存在差异。
本论文的第二部分中我们在中国上海女性人群中开展了一项关于体内维生素D水平和乳腺癌患病风险之间的关联研究。研究发现我国女性人群尤其是乳腺癌疾病人群中维生素D营养状态严重缺乏，并且维生素D的缺乏能够显著增加乳腺癌患病风险；同时利用Meta分析的方法对已发表的关于维生素D和钙对乳腺癌发生风险影响的论文进行综合分析发现：高水平的维生素D和钙的摄入能够分别降低乳腺癌的发生风险大约9%(OR=0.91，95% CI=0.85-0.97)和19%(OR=0.81，95% CI=0.72-0.90):血液中25(OH)D处于最高水平的女性患有乳腺癌的风险比最低水平降低45%(OR=0.55，95% CI=0.38-0.80):而血液中la,25(OH)2D的水平和乳腺癌发生风险无关(OR=0.99，95% CI=0.68-1.44)。以上研究显示维生素D和钙在乳腺癌的发生和预防中可能具有重要的生物学功能和作用。