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石斑鱼是世界重要海水名贵鱼类,养殖范围从我国的南方沿海城市逐渐发展到北方山东、天津等地,其具有重要的经济价值,市场需求大,受到人们的广泛的关注,20世纪末,研究学者们相继开展了石斑鱼人工繁殖与杂交育种技术,突破了石斑鱼在人工繁育上的瓶颈,使得石斑鱼产业取得了巨大的发展。石斑鱼杂交育种的目的是为了获得具有抗病力强,生长速度快,肉质鲜嫩等优点的新品种。本研究对云纹石斑鱼(♀)、鞍带石斑鱼(♂)及其杂交后代云龙斑进行群体形态差异分析,并在分子水平上利用微卫星标记对云纹石斑鱼(♀)、鞍带石斑鱼(♂)及杂交后代云龙斑进行群体间的遗传多样性分析和亲缘关系鉴定,在此基础上,比较了各个家系间的生长性状。主要研究结果综述如下:(1)杂交种云龙斑与亲本群体的形态差异分析云纹石斑鱼(♀)和鞍带石斑鱼(♂)在分类上属于鮨科、石斑鱼属不同种鱼类,它们在外部形态特征上具有明显的差别。利用多元分析方法(主成分分析、聚类分析、判别分析)对云纹石斑鱼、鞍带石斑鱼及其杂交后代云龙斑的可量、可数性状做了相关统计分析。研究结果显示,利用19个比例性状数值对鞍带石斑鱼、云纹石斑鱼及杂交后代云龙斑三个石斑鱼群体进行聚类分析,根据聚类分析树形图与群体间的欧氏距离,云龙斑与母本云纹石斑鱼遗传距离较近,与父本鞍带石斑鱼较远。本研究共有6个主成分,累积总变异贡献率为74.945%,鞍带石斑鱼、云纹石斑鱼及杂交后代云龙斑三个群体形态差异明显,形成三个不同的群体,杂交种云龙斑具有特有的形态特征。云龙斑与云纹石斑鱼形态偏离较小,与鞍带石斑鱼形态偏离较大。利用逐步判别法从19个形状中筛选出吻长/体长、体高/体长、尾柄高/体长、腹鳍基部至臀鳍前端基部长/体长共4个贡献率大的参数建立判别函数,综合判别率达96.43%,可将云龙斑与亲本区分开,为云龙斑的种质鉴定奠定了基础。综上所述,云龙斑的形态特征偏向于母本云纹石斑鱼,同时也存在杂种优势。(2)云纹石斑鱼和鞍带石斑鱼及其杂交后代遗传性状分析微卫星标记(SSR)是鱼类遗传多样性分析的有效方法,本研究利用石斑鱼(Epinephelus)近缘种的27对微卫星引物,分析鞍带石斑鱼(♂)、云纹石斑鱼(♀)及其杂交子一代云龙斑的遗传性状,其中有25对SSR标记在云龙斑中检测到多态性。通过Popgene32软件计算有效等位基因数(Ne),期望杂合度(He),观测杂合度(Ho),香侬信息指数(I),Nei氏遗传距离(Nei),多态信息含量(PIC),总体近交系数(Fit),群体内近交系数(Fis)及遗传分化系数(Fst)等遗传多样性参数,分析群体间的遗传变异情况。结果表明,在3种石斑鱼群体中,云纹石斑鱼平均有效等位基因数最多(2.8926),云龙斑次之(2.8010),最小的是鞍带石斑鱼(2.0564)。云纹石斑鱼、鞍带石斑鱼和云龙斑共3个群体的平均观测杂合度依次分别为:0.6046、0.5010、0.5661,平均多态信息含量分别为:0.5798、0.3420和0.5446。3个群体总近交系数为0.1508,群体间遗传分化系数为0.0677,表明有93.23%的遗传变异来自群体内个体间的差异,6.77%的遗传变异来自群体间,群体间近交系数为-0.0722,群体间基因流(Nm)为2.3963。基于Nei’s遗传距离构建UPGMA聚类分析,显示云龙斑与云纹石斑鱼遗传相似度较高,遗传距离较近。研究结果在分子水平上为杂交品种云龙斑的杂种优势性状形成,以及杂交种质鉴定提供了遗传基础。(3)云龙斑亲缘关系鉴定及家系生长数量性状分析本研究利用筛选出的9对多态性丰富的微卫星标记对杂交子代云龙斑家系的亲缘关系进行鉴定。通过荧光标记合成引物进行PCR扩增,利用毛细管电泳进行基因分型,通过Cervus 3.0软件分析结果表明,9个标记的平均基因数为15.67,PIC平均值为0.779,Ho平均值为0.888,He平均值为0,801,在亲本基因型未知时,累计非父排除率为0.9974213,在已知一个亲本基因型时,累计非父排除率为0.99992718,累计非父排除概率为0.99999991,同时结合LOD值的大小,在300尾子代中成功鉴定出266尾的亲本,鉴定率为88.6%。利用SPSS19.0软件和Excel2013对鉴定的子代进行家系间的生长比较,结果显示,编号为4、8、9、18、19、21、22、24共8个家系中,其平均体重和平均全长明显优于其它家系,具有良好的生长优势和选育潜力。