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番茄叶霉病是危害番茄生产的一种严重病害,也是生理小种分化最激烈的病害之一。为了能够有针对性的选择使用抗源,对叶霉病菌生理小种的变化需要及时监测,因此,急需研究找出一种快速简单、不受环境因素影响的鉴定新方法。本研究以番茄叶霉病菌8个已知生理小种和2009年采自东北三省的42个未知菌株为材料,利用SSR和AFLP分子标记技术构建8个生理小种的DNA指纹图谱,并依据分子指纹图谱信息建立聚类树状图,对8个生理小种进行聚类分析。在对42个未知菌株进行常规寄主鉴定后,再利用筛选出的特异引物扩增指纹,对比于已建立的图谱,检验图谱鉴定和常规鉴定的符合率。本研究的主要研究成果如下:1.应用SSR分子标记技术筛选得到多态性丰富的引物3对,对8个番茄叶霉病菌供试生理小种进行研究分析,建立DNA指纹图谱。3对引物共扩增出219条带,扩增出多态性条带22条,多态性带占总带数的10.04%。每对引物得到的8个叶霉病菌生理小种的SSR指纹图谱均不同,能将8个生理小种完全区分开。AFLP技术因未能成功扩增出条带,不能用于8个生理小种指纹图谱的构建。2.依据SSR指纹图谱反映出的信息建立聚类树状图,聚类结果显示:番茄叶霉病菌群体内存在较丰富的遗传多样性。小种1.2.4和1.3之间相似系数值最大,为0.86;2.3与其它小种之间的相似系数最小,为0.53。在Dice相似系数0.53水平上,可以将供试的8个菌株划分为2个类群。3.对2009年采自东北三省的番茄叶霉病菌菌株进行常规寄主鉴定,结果显示供试的42个菌株分别属于生理小种1.2、1.2.3.、1.2.3.4、1.2.4、1.3、1.3.4、1.4和2.3,全部为已经鉴定存在的小种,其中以1.2.3.4为主流小种,约占调查总数的30.95%,;其次为生理小种1.2.3,约占调查总数的16.67%。试验鉴定并未发现新分化的生理小种。4.利用3对SSR特异引物M69、M80、M91对使用鉴别寄主法鉴定的42个菌株进行扩增,得到SSR指纹,与已做出的8个生理小种指纹图谱对比后发现,引物M69和M80的小种指纹鉴定结果与常规寄主鉴定结果符合率为100%;引物M91的鉴定结果由于41号菌株的不同,与常规寄主鉴定的符合率为97.62%。本研究证明:DNA指纹图谱可以应用于番茄叶霉病菌生理小种的鉴定,是一种快速准确的新方法。