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目前，一些内江河道污染非常严重，特别是在环境容量相对较小的枯水期，污染形势不容乐观，进行污染防治工作刻不容缓。在许多流域的污染因素中，非点源污染占据着越来越大的比例。由于非点源污染的复杂性、污染负荷模型的不成熟性和模型的区域局限性，给非点源污染负荷的计算以及统计非点源污染危害等方面的工作带来了很大的不便。
水质模型从1925年以来，经过一维稳态向三维动态，从单一河道到河网、水库、湖泊与海湾，从单一水质要素到综合水质模型，从确定性水质模型到灰色水质模型这几个阶段的发展，现在已经能够满足一般的实际应用，但是对于结合流域非点源的排入和水流来回振荡的河口情况来说，还有待于进一步深入研究。
本文以镇江市运粮河为具体研究对象，以其历年的监测数据为基础，通过调查研究，对运粮河水环境质量进行评价，确定其主要污染物；在对运粮河流域的地理条件、社会、经济发展调查分析的基础上，综合参考了类似地区非点源污染监测资料，建立非点污染源污染负荷的计算模型；运用实验并结合经验公式，确定水文、水力和水质参数，并在此基础上建立枯水期BOD水质模型；在该模型计算结果和监测数据相吻合的基础上，用该模型对点源与非点源污染治理措施的效果进行预测。
研究表明，运粮河的污染以有机污染为主，枯水期污染非常严重：在运粮河流域，非点源污染占很大比例，是造成运粮河污染的主要原因，其中由于河底底泥造成的污染最为恶劣，其次是城市雨水径流给运粮河带来的污染，沿岸居民的生活污水和农业污水在非点源污染中相对较少；河流一端连着长江，一端连着内江，属于感潮河段，因此采用一维潮周平均模型来模拟河口附近的水质情况，中间受潮汐影响较弱的部分采用稳态的一维S—P模型，模拟结果与实际监测数据比较接近；根据运粮河以非点源污染为主，建议采用生活污水截流、改变路面径流系数、清除河底污泥、生态修复和进行农业污染控制等措施；效果预测结果表明在生活污水截流的前提下，采用生态修复结合底泥清淤的措施是经济有效的方法。