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番茄（Lycopersicon esculentum.Mill）为喜光作物,在冬春设施栽培中常遭遇弱光胁迫,严重影响其早期形态建成。为明确弱光对番茄幼苗生长发育的影响及其耐弱光机制,本研究在人工气候室条件下,以600μmol·m-2·s-1光强为对照,100μmol·m-2·s-1光强为处理,从15个番茄品种中筛选得到耐弱光番茄品种‘YF’和弱光敏感品种‘906’,并从植株生长发育、抗氧化系统、光合电子传递和转录组学等方面进一步研究。主要结果如下:1.弱光下15个番茄品种的株高、茎粗、干鲜物质量、壮苗指数、总叶绿素含量和净光合速率的变异系数在-108.16%73.10%之间,且各指标具有一定相关性,采用主成分分析法计算特征向量并得到15个番茄品种的综合评价值,之后使用聚类分析将15个品种划分为4个等级,分别得到弱光敏感品种‘906’和耐弱光品种‘YF’。2.弱光胁迫导致‘906’和‘YF’两品种番茄幼苗生长受阻,表现为植株干鲜重、叶面积、根系构型参数和根系活力显著降低;全株N、P和K含量显著升高,Ca含量则减少;H2O2和O2-含量减少,SOD和CAT活性降低,POD活性升高,MDA则无显著差异。3.弱光下‘906’和‘YF’的叶绿素含量均显著增加,叶片厚度降低,栅栏组织/海绵组织增加;叶片对红橙光和蓝紫光吸收比例增加,表现为PSII单位反应中心吸收光能（ABS/RC）增加,但PSI和PSII实际量子产量和电子传递速率降低,热耗散增加,PSI受体侧受到严重抑制。4.与弱光敏感品种‘906’相比,耐弱光番茄品种‘YF’的生物量变化幅度较小,叶片较厚,捕光色素蛋白（LHCb1）表达量升高,植株叶片对红橙光、蓝紫光和远红光吸收率增加;其较高的PQ size和铁氧还原蛋白（Fd）表达量增强了光系统间电子传递效率,环式电子传递（CEF）的增加则减轻了PSI受体侧氧化胁迫程度。5.通过弱光敏感和耐弱光番茄品种的转录组学分析发现,差异基因主要富集在了MAPK、激素信号转导、苯丙酸生物合成和淀粉蔗糖代谢通路,且与弱光敏感品种相比,耐弱光番茄品种的SlCaM2和HY5表达量特异性上调,具有潜在的提高耐弱光能力的作用。