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目的：DNA甲基化(DNA methylation)是主要的表观遗传修饰，它与肿瘤的发生有着密切的关系。DNA甲基化在发育、癌症、衰老等过程中扮演着重要的角色，所以研究DNA甲基化在发育过程中的作用机制很有意义。
方法：本课题采用神经组织发育过程中的细胞以及7种成体组织的CpG位点甲基化数据，在对每个CpG岛进行基因组定位的基础上，通过预处理的基因表达谱得到CpG岛对应的RefSeq基因表达值以及取得CpG位点所对应的Refseq基因，从而取得CpG位点甲基化--基因表达对，来研究CpG位点甲基化与基因表达之间的关系。
结果：胚胎干细胞发育和分化的过程中，CpG点位点的甲基化水平呈现了一种先获得甲基化而后又失去甲基化的动态变化。成体组织的细胞呈现一种低甲基化的状态，且各组织之间的差异较小。在各种细胞状态下，CpG岛内的CpG位点均呈现显著的低甲基化，而岛外的CpG位点则呈现高的甲基化水平。相对胚胎干细胞和初始组织细胞，发育过程中的细胞无论岛内还是在岛外，都呈现较高的甲基化水平。各组织之间CpG岛区域的CpG位点的甲基化水平差异较小，而在岛外则显示出较大的差异。重复序列中CpG位点则呈现一致的超高甲基化水平，且各种细胞状态之间的差异不大。
结论：各功能区域中组织细胞间CpG位点甲基化水平之间存在相对较弱的相关性。各个区域中成体组织细胞中CpG位点的甲基化水平之间存在较高的相关性。