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水稻作为世界上比较重要的粮食作物之一,发掘控制稻米品质优异基因并进一步用于水稻遗传育种具有十分重要的意义。本论文以477份水稻材料为研究对象,构建一个自然变异群体,研究该群体的遗传多样性,并深入研究其群体结构。以期以后对水稻相关性状的关联分析奠定一定的基础。主要研究结果如下：1、44个随机引物中共扩增出186个等位基因位点,平均每个位点4.227个等位基因。各材料间不同位点的等位基因数大多不等,范围2(RM6297)-9(RM1235)；SSR水平的基于Neis基因多样性指数平均为0.23