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第一部分藏鸡三个基因的SNPs检测及其与生长性状的关联分析藏鸡是我国青藏高原在原始饲养状态下保存下来的珍贵家禽品种。藏鸡具有耐寒、抗病、抗缺氧、肉质鲜美、药用价值较高,耐粗放和可观赏性强等优良特性,同时也有生长速度慢、产蛋率低的缺点。如何在保存好这一珍贵遗传资源的同时,通过经济杂交和产品开发利用好藏鸡就成为当前重要的研究课题。本研究以我室所建的藏鸡与隐性白羽群体为材料,通过利用生物信息学分析方法,利用分子生物学技术克隆和分离与藏鸡生长性状有关的基因,为分子标记辅助选择提供分子基础。主要取得了如下结果:1.根据鸡SNPs数据库信息设计引物,通过PCR方法对MSTN基因进行SNPs筛查,发现第1外显子上有2个同义突变位点A2100G,A2109G。对于2个位点,G等位基因均占优势,每个位点的3种基因型频率在2个品种间均没有显著差异。与藏鸡的部分生长性状的关联结果表明,A2100G位点与16周龄体重存在显著相关(P＜0.01);A2109G位点与初生胫长、4周龄管围存在极显著的相关(P＜0.01)。2.根据鸡SNPs数据库信息设计引物,通过PCR方法对CMYA3基因进行SNPs筛查,发现第4外显子上有4个同义突变位点,T1182C,A4950G,A7776G,A8140G。对于T1182C位点,T等位基因占优势;A4950G,A等位基因占优势;A7776G,A8140G,G等位基因均占优势;每个位点的3种基因型频率在2个品种间均没有显著差异。与藏鸡的部分生长性状的关联结果表明,T1182C位点与2周龄体重存在显著的相关(P＜0.05);A4950G位点与2周龄体重和4周龄胫长呈相关趋势;A7776G位点与初生胫长显著相关(P＜0.05);A8140G位点与16周龄体重极显著相关(P＜0.01)。3.根据鸡SNPs数据库信息设计引物,通过PCR方法对CMYA5基因进行SNPs筛查,发现第2外显子上有2个错义突变位点T1541G(Ser-Cys),T1618C(Val-Gly)。对于2个位点,T等位基因占优势,每个位点的3种基因型频率在2个品种间均没有显著差异。与藏鸡的部分生长性状的关联结果表明,T1618C位点与初生胫长极显著相关(P＜0.01),4周龄体重显著相关(P＜0.05);T1541G位点与初生管围显著相关(P＜0.05)。乌骨鸡是一种珍贵的中国地方鸡种，以其独特的滋补、药用价值享誉中外。研究表明乌骨鸡的营养及药用价值与其体内所含的黑色素有关。黑羽乌骨鸡和白羽乌骨鸡都具有分泌黑色素的能力，且黑色素能够在皮肤、肌肉和骨骼中沉积，但是显然在白羽乌骨鸡中，黑色素难以沉积到羽毛中，研究黑羽与白羽乌骨鸡羽毛中色素沉积差异产生的遗传调控机制，对阐明黑色素沉积的分子机理具有重要的理论意义。假定控制黑羽与白羽相对差异的基因座位分别在两品种中均已纯合，采用金水乌鸡白羽丝毛系和黑羽丝毛系进行杂交实验，得到Fl代个体后进行F1横交，生产F2代个体，使得性状实现分离，在此资源群体中结合全基因组QTL扫描和候选基因法定位控制这一相对性状的基因座位。依据这一设想，本研究已经开展了下列实验：1．亲本正反交实验：采用3只黑羽公鸡与3只白羽母鸡进行正交，3只黑羽母鸡与3只白羽公鸡进行反交，共得到29只F1代仔鸡；杂交F1代出现黑羽和花羽两种羽色。2．F1代横交实验：利用正交组F1代的黑羽公鸡与黑羽母鸡杂交、花羽公鸡与花羽母鸡杂交、黑羽公鸡与花羽母鸡杂交、花羽公鸡与黑羽母鸡杂交；利用反交组F1代黑羽公鸡分别与正交组黑羽母鸡、花羽母鸡进行杂交；杂交已经得到部分40只F2代仔鸡。3．应用PCR技术检测了“C”座位等位基因状态(TYR基因第四内含子的逆转录病毒插入突变)，结果显示黑羽全部为CC基因型(无插入)，白羽全部为cc基因型(有逆转录病毒插入)。分析以上已经取得的初步结果可以推测，控制黑羽与白羽相对差异的基因座位除了已经鉴定的“C”座位之外，还应该有其它基因座位的参与，值得进一步的研究。本研究已经取得的初步结果为下一步研究奠定了基础。