【摘 要】
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目的:比较COVID-19疫情前后儿童口咽部菌群的差异,分析疫情相关公共卫生措施对儿童口咽部菌群的影响。方法:分别选取2018年12月5日至2019年7月31日期间(COVID-19疫情前)和2020年10月27日至2020年12月5日期间(COVID-19疫情后),于河北医科大学第三医院就诊的非感染儿童,作为疫情前后健康儿童组,同期儿内科住院肺炎患儿作为疫情前后肺炎患儿组,采集口咽拭子,进行16
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目的:比较COVID-19疫情前后儿童口咽部菌群的差异,分析疫情相关公共卫生措施对儿童口咽部菌群的影响。方法:分别选取2018年12月5日至2019年7月31日期间(COVID-19疫情前)和2020年10月27日至2020年12月5日期间(COVID-19疫情后),于河北医科大学第三医院就诊的非感染儿童,作为疫情前后健康儿童组,同期儿内科住院肺炎患儿作为疫情前后肺炎患儿组,采集口咽拭子,进行16S r RNA基因测序,应用SPSS 26.0统计软件进行统计学分析。结果:1.口咽部菌群门水平物种组成分析:与疫情前健康儿童组相比,疫情后健康儿童组Fusobacteria(梭杆菌门)相对丰度增高(P=0.049<0.05),Actinobacteria(放线菌门)相对丰度降低(P=0.002<0.01),差异有统计学意义;与疫情前肺炎患儿组相比,疫情后肺炎患儿组放线菌门相对丰度降低(P=0.001<0.01),差异有统计学意义;2.口咽部菌群属水平物种组成分析:与疫情前健康儿童组相比,疫情后健康儿童组Actinomyces(放线菌属)相对丰度降低(P=0.000<0.01),差异有统计学意义,Fusobacterium(梭杆菌属)、Prevotella(普雷沃氏菌属)及Capnocytophaga(二氧化碳噬纤维菌属)相对丰度增高,统计学分析结果分别为P=0.010<0.05,P=0.034<0.05,P=0.041<0.05,差异有统计学意义;与疫情前肺炎患儿组相比,疫情后肺炎患儿组放线菌属及Haemophilus(嗜血杆菌属)相对丰度降低,统计学分析结果分别为P=0.000<0.01,P=0.034<0.05,Alloprevotella(拟普雷沃菌属)相对丰度增高(P=0.007<0.01),差异有统计学意义;3.口咽部菌群多样性分析:与疫情前健康儿童组相比,疫情后健康儿童组Shannon指数更低,Alpha多样性降低,丰富度降低(P=0.023<0.05),均匀度升高(P=0.008<0.01)。Beta多样性分析示:疫情前后健康儿童组相比,组间有显著性差异(P=0.004<0.01),PCo A分析疫情后健康儿童组口咽部菌群结构更具相似性;与疫情前肺炎患儿组相比,疫情后肺炎儿童组Shannon指数更低,Alpha多样性降低,丰富度降低(P=0.001<0.01),均匀度升高(P=0.027<0.05)。Beta多样性分析示:疫情前后肺炎患儿组相比,组间有显著性差异(P=0.003<0.01),PCo A分析疫情后肺炎患儿组口咽部菌群结构更具相似性。结论:1.COVID-19疫情前后儿童口咽部菌群组成发生显著变化,其主要表现为健康儿童及肺炎患儿放线菌门、放线菌属相对丰度于疫情后均明显降低,健康儿童梭杆菌门、梭杆菌属、普雷沃氏菌属、二氧化碳噬纤维菌属相对丰度于疫情后升高,肺炎患儿拟普雷沃菌属相对丰度于疫情后升高,嗜血杆菌属相对丰度于疫情后降低。2.与疫情前相比,疫情后儿童口咽部菌群Alpha多样性降低,其中丰富度降低,均匀度升高。3.COVID-19疫情期间采取公共卫生措施,可能对儿童口咽部菌群结构产生影响,疫情后儿童口咽部菌群结构可能较疫情前更具相似性。
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