氟斑牙与CLCN7基因多态性相关性的研究

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地方性氟中毒(endemic fluorosis)是一种常见的环境地球化学性地方病,该病主要侵犯骨骼(氟骨症)、牙齿(氟斑牙),以往研究认为是由于长期生活在高氟环境中摄入过量的氟而导致[1]。本课题组近年着重于研究陕西省氟斑牙流行病学的发生和机理,关注高氟区常住居民氟斑牙临床表现、发病情况及其相关的基因背景,逐渐发现氟斑牙致病机制与氯通道基因相关。基于在相同高氟环境中的个体产生不同患病情况的基因背景存在差异,本研究在前期课题组的研究基础之上,将进一步分析氯通道基因与氟斑牙患病率的相关性,探索氯通道与氟斑牙发生的关系。方法:一:采集陕西健康人群血样132例,提取基因组DNA;应用质谱基因多态性分型检测技术(MassArray)对CLCN7基因的3个单核苷酸多态性位点(Singlenucleotide polymorphisms,SNP)rs11645645、rs2235579、rs2745001进行基因分型;并将分型结果与人类单体型基因组数据库(Hapmap)中中国汉族人群(Han Chinesein Beijing, CHB)、日本人群(Japanese in Tokyo, JPT)、欧洲人群(Utah residents withNorthern and Western European ancestry from the CEPH collection, CEU)的基因分型进行比对。二:针对高氟区陕西省安康市紫阳县进行样本采集工作,采集受检对象外周血样本,用磁珠法获取基因组DNA。结合课题组前期氟斑牙流行病学研究样本,应用Mass Array方法对高氟区样本做CLCN7基因多态性位点分型,分析各SNP位点的基因分型在氟斑牙患病组和正常对照组之间的差异,并将分型结果与Hapmap中CHB、JPT、CEU的基因分型进行比较。三:从受检样本中随机抽取100份血样(氟斑牙患者50份,正常对照50份),获取这100份血样的mRNA,针对CLCN7基因进行荧光实时定量PCR扩增,以研究目的基因在正常对照组和病例组之间表达量的差异。结果:1.初期调查的132例健康人群所选位点的基因分型与中国人群分布一致(P>0.05),但与欧洲人群的分布存在显著差异(P<0.05)。2.本研究共纳入1723份基本资料信息完整的样本,其中氟斑牙患者889例,对照组834例;男性909例,女性814例,受检人群年龄范围从12到77岁,平均年龄为38岁。实验样本rs11645645、rs2235579、rs2745001基因分型在病例组和对照组之间无统计学差异(P>0.05),样本各位点基因分型与中国人群分布一致(P>0.05),但与欧洲人群的分布存在显著差异(P<0.05)。3.荧光实时定量PCR结果显示:病例组CLCN7基因mRNA水平的相对表达量比对照组降低。结论:1.本实验选取的陕西健康人群具有代表性,其CLCN7基因多态性位点基因分布与数据库列举的中国人群近似;rs11645645、rs2235579、rs2745001位点可作为亚洲人群CLCN7的标志SNP位点。2.依据本研究选取的rs11645645、rs2235579、rs2745001位点,尚不能认为CLCN7基因多态性与氟斑牙的发病存在显著相关,其原因可能与选择的多态性位点有关,rs11645645、rs2745001都是非功能性的SNP位点,rs2235579位点的变异可改变CLCN7基因的外显子剪切增强子(Exonic splicing enhancer,ESE)的数量和种类。对氟斑牙与CLCN7基因多态性的相关研究还需要对后续功能性位点的进一步排查。3.氟斑牙患者CLCN7基因在mRNA水平的相对表达量比正常对照组降低,表明氟与ClC-7之间的确存在一定的关联,一方面可能是氟离子直接对ClC-7产生影响,另一方面可能是氟离子通过某些表观遗传调控机制调节CLCN7基因的表达。本研究主要针对陕西省高氟地区进行大样本流行病学研究,结合有关氟离子与氯通道关系的研究,探究氟斑牙与CLCN7基因多态性之间的相关性,发现氟斑牙人群CLCN7的mRNA水平表达量降低,其原因从CLCN7基因组的水平尚不能给予足够解释,可能与CLCN7的转录后调控有关,具体机制将在以后进行研究探索。
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