湘潭锰污染土壤中可培链霉菌多样性及两株新物种的多相分类

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放线菌属于革兰氏阳性的一类原核微生物,它们分布于各种各样的环境。由于产生有益的代谢物,它们在医药、食品、工农业等多个领域上具有巨大的应用价值和潜力,因而其研究得到了研究人员的广泛关注,尤其是链霉菌。据报道,至2010年微生物产生的活性物质已有超过30000种被发现,其中由放线菌产生的具有生物活性的次级代谢产物达到13000多种,链霉菌产生的物质约7600种。本研究从湘潭锰矿污染区(N27°53’-28°03’,E112°45’-112°55’)及周边环境的土壤分离得到1200多株放线菌,通过结合菌落的培养特征和16S r RNA基因序列,最终得到51株菌落形态、特征不同的链霉菌。由此可知:湘潭锰污染土壤中存在丰富多样的链霉菌。初步的研究结果表明:菌株LUSFXJ,MKLv,MK 44,MK 45和MK47可能为潜在的链霉菌新物种。本研究选取菌株LUSFXJ和MK 44进行了多相分类鉴定,研究结果如下:(1)菌株LUSFXJ,分离自锰矿污染区或周边环境的土壤,16S r RNA基因序列以及孢子形态、结构特征和培养特征均表明:菌株LUSFXJ属于链霉菌。甲基萘醌包含MK-9(H6),MK-9(H8),MK-9(H2)和MK-8(H8)。磷脂类型包括双磷脂酰甘油(DPG)和一个未鉴定的极性脂。脂肪酸主要成分为iso-C1 5:0,anteiso-C1 5:0,iso-C16:0,C16:0和summed Feature 3。菌株LUSFXJ的细胞壁含有meso-DAP,细胞水解产物含有核糖,甘露糖和葡萄糖。菌株LUSFXJ与进化关系最近的参照菌株的杂交率远远低于70%。根据形态特征、生理生化特征以及DNA的分子杂交结果,确定菌株LUSFXJ是链霉菌的一个新种,并将其命名为Streptomyces(2)菌株MK 44,分离自锰矿污染区的土壤。根据菌落的形态、培养特征、生理生化特征的比较和16S r RNA基因序列分析,我们可以得出:菌株MK 44属于链霉属,同时明显区别于同源性>97%有效发表的种。其与选择的菌株S.speciali JCM 16611T和S.mayteni JCM 16957T的杂交值分别为30.90±0.28%和29.86±3.51%远远低于Wayne et al(1987年)提出的70%作为新种的界限。因此可以判断该菌为链霉菌的潜在新种,并将其命名为鹤岭链霉菌Streptomyces heling sp.nov.(=GDMCC 4.137T=KCTC 39920T)。
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