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目前我国海岸滩涂养殖比较兴旺，但是由养殖产生的污水对海岸生态环境造成了较大的负面影响，如何降低水产养殖过程中产生的水体污染，成为了国内外研究热点，而红树植物已被证实具有较好的净化水质效果。本课题首先在珠江口海上田园构建500亩3个系统共12个红树种植—养殖耦合试验塘，从水质因子和生态因子等方面探讨不同红树品种的耦合系统对污水净化和提高水产品质量产量的效果，进而筛选出最佳的构建塘红树组成，以便推广应用。本论文研究于2008年6月、2008年9月、2008年11月以及2009年1月对各个养殖塘的水体理化因子和浮游藻类群落结构进行综合生态调查，以分析和比较不同红树种植塘的富营养化程度和红树植物对水质的净化能力，从而筛选出最佳的构建塘红树构成。主要研究结果如下：
(1)红树植物均能够提高水体的透明度，各个养殖塘对于BOD5、DIN、PO4-P等均有不同程度的净化作用。从理化指标分析，秋茄—桐花树外供水系统和秋茄—桐花树原位水系统对水体的净化效果并无显著差异，木榄—红海榄原位水系统的红海榄塘和木榄—红海榄混种塘对水体的净化效果较好。
(2)四次调查期间共鉴定出浮游藻类170种(含变种、变型)，隶属于7门52属。其中，裸藻和绿藻在种类组成上占据一定优势，四次调查共获得12种优势浮游藻类。通过叶绿素a浓度、浮游藻类群落结构聚类分析和排序表明，木榄—红海榄原位水系统的红海榄塘和木榄—红海榄混种塘具有较好的降低富营养化能力。综合理化指标和浮游藻类群落结构判断，种植红海榄和木榄—红海榄混种的种植—养殖模式值得推广。
(3)四次调查期间浮游动物的捕食作用较强地影响着各个养殖塘的浮游藻类数量。2008年9月到2008年11月，各个养殖塘基本表现出明显的无机磷限制，因而此时浮游藻类主要以利用水体中的溶解态有机磷为主，2009年1月，由于底泥无机磷的释放，导致一些塘浮游藻类的丰度明显增加。
(4)通过对四次采样的多样性指数与CODMn、NH4-N以及PO4-P作相关性分析，本研究认为要谨慎对待这些多样性指数对水体污染程度的评价结果，有机污染压迫还是营养盐污染压迫或者是其它生态因素对浮游藻类起主导作用直接关系到多样性指数反映的污染类型。建议用多样性指数评价时应结合水体理化指标和生态指标来对水体污染程度和污染类型进行综合分析。