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应用微卫星标记技术以6个品种鹅(东北白鹅、籽鹅、皖西白鹅、豁眼鹅、莱茵鹅、朗德鹅)为试验材料研究6个品种鹅的遗传结构,通过DNA提取、PCR扩增、凝胶电泳检测等一系列分子操作技术,分析了7个微卫星位点(WD206、WD136、CKW4、CKW5、CKW21、CKW23、CKW24)的群体遗传变异,包括多态信息含量(PIC)、等位基因频率(AF)、群体杂合度(H)、有效等位基因数(Ne)等,从分子水平上揭示6个品种鹅的遗传差异和亲缘关系。试验结果表明,所选择的微卫星标记在不同品种鹅群体中表现有良好的多态性,7个微卫星位点中共检测到70个等位基因,每个位点的平均等位基因为10个,各位点等位基因数为6~16个不等,等位基因频率介于0.0185~0.7000之间,有6个等位基因为6个品种所共有,6个不同鹅品种微卫星多态性不平衡,其中WD206位点上的等位基因数最多,WD136上最少。各位点平均多态信息含量在0.5497~0.7766,均大于0.5,表现为高度多态。各群体平均杂合度为0.6617(莱茵鹅)~0.8134(籽鹅),说明国内地方品种具有比国外引进的鹅种更丰富的遗传多样性,同时也说明国内的地方品种遗传一致性差,需要进一步的纯繁选育。利用6个微卫星位点所提供的多态信息,计算6个品种鹅相互间的遗传距离,并以此绘制出UPGMA聚类图,其中东北白鹅和籽鹅遗传距离最小为0.1551,首先聚在一起,然后再分别与主产区位于山东莱阳的豁眼鹅和安徽的皖西白鹅归为一类,外来鹅种莱茵鹅和朗德鹅遗传距离较小为0.3244,聚为另一类,这些结果与鹅种的起源,地理分布及使用的经济类型是一致的,表明微卫星标记可准确地反映6个品种的亲缘关系及其所在地域分布上的差异,本方法适宜于群体遗传结构及遗传关系的研究,是畜禽遗传多样性研究与保护的有效分析手段。