拟南芥中SC35及SC35类似富含丝氨酸和精氨酸蛋白在mRNA剪接和转录调控过程中的功能研究

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SR蛋白家族是生物体内富含有丝氨酸/精氨酸(serine/arginine-rich)的一类非常保守的蛋白家族。SR蛋白是剪接复合体的重要组成部分,并且参与了生物体内的组成性剪接和选择性剪接过程。动物中关于SR蛋白的研究有很多,但是由于功能的冗余性植物中对SR蛋白的研究比较少。根据亲缘性关系我们构建了SR蛋白不同亚家族之间的多突变体植株,进而分析了拟南芥中SR蛋白的功能。我们发现缺失了SC35及SC35-like(SCL)蛋白的sc35-scl五突变体与野生型(WT)相比出现了明显的表型差异,包括:叶片锯齿,晚花,根长变短以及不规则的果荚排列。转录组表达谱分析发现SC35/SCL蛋白参与了前体mRNA(pre-mRNA)的剪接过程。生物信息学分析表明SC35/SCL蛋白偏好识别一个含有GAAGA的结构序列,体外的RNA EMSA实验表明SC35/SCL蛋白能够直接结合这个序列。同时,转录制测序也发现sc35-scl突变体中许多基因的表达量也发生了变化。蛋白互作实验发现,SC35/SCL能够与RNApolymeraseⅡ的一个特定亚基NRPB4存在相互作用,表明SC35/SCL可能也参与了转录过程。sc35-scl表现出比较明显的晚花,转录组分析发现调控拟南芥开花的关键因子FLOWERINGLOCUSC(FLC)表达量升高。对sc35-scl中的FLC表达量变化进一步研究发现,SC35/SCL调控了FLC第一个内含子的剪接,并且也影响了FLC的转录。因此,SC35/SCL通过在转录和剪接两方面调节FLC的表达从而调节了拟南芥的开花过程。以上实验结果显示,拟南芥中的剪接因子SC35/SCL蛋白通过调节植物体内mRNA前体的剪接和转录过程维持生物体内基因的正常表达进而调节植物的正常发育过程。
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