NF-κB信号通路相关基因多态性、环境因素与肺癌关联的病例对照研究

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:rogy520111
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[目的]探索原发性肺癌的环境危险因素、研究NF-κB炎症信号通路上相关基因多态性及其micro RNA单核苷酸多态性与肺癌易感性的关联、探讨NF-κB炎症信号通路上相关基因单体型与肺癌的易感性。[方法]1.采用配对病例-对照研究,按性别、年龄(±3岁)匹配,共纳入1534对研究对象。采用一对一面访的形式填写问卷,收集研究对象的暴露信息。运用单因素条件Logistic回归、多因素条件Logistic回归分析肺癌危险因素。运用R软件随机森林分析筛选最重要的危险因素。2.运用生物信息学方法筛选NF-κB信号通路中有关基因NFKBIA、IKBKAP、TAB3、CXCL12及其候选SNPs,采用飞行时间质谱法对候选SNPs进行基因分型。运用χ2检验分析SNPs基因型及等位基因在病例组和对照组中的分布差异;运用非条件Logistic回归分析SNPs与肺癌易感性的关联、与不同病理类型肺癌易感性关联以及与不同吸烟人群肺癌易感性的关联。3.运用Haploview对SNPs进行连锁不平衡检验,并构建单体型;应用R软件运行Haplo.stats程序包,计算病例组和对照组单体型分布频率;运用haplo.glm模型构建单体型与肺癌广义线性回归模型,计算单体型与原发性肺癌的关联。[结果]1.福建地区原发性肺癌的危险因素有:居住地附近有污染企业、体质指数<18.5、居室通风状况不良、烹调油烟较多、未使用排气扇或抽油烟机、使用排气扇≤10年、装修后有刺激性气味、吸烟、吸烟包年数、初始吸烟年龄、被动吸烟指数≥10人年、性格内向忧郁、饮酒、肺部炎症疾病史、肿瘤家族史、肺癌家族史、近10年家庭有重大变故、吃咸菜(1~3次/周)。肺癌的保护因素有:BMI≥24、体育锻炼(≥1次/周)、经常散步、生吃大蒜(>2次/周)。2.SNPs与肺癌的易感性研究结果显示:NFKBIArs8904 TT基因型携带者发生肺癌的风险是CC基因型的0.761倍(95%CI:0.598~0.968)、携带rs1050851CT的肺癌患病风险是携带CC基因型的0.601倍(95%CI:0.363~0.995)。携带IKBKAPrs2230793 CC基因型者肺癌患病风险是AA+AC携带者的1.386倍(95%CI:1.007~1.907)。携带rs1538660 TT基因型发生原发性肺癌是携带CC基因型的0.713倍(95%CI:0.515~0.986)、是携带CC+CT基因型的0.724倍(95%CI:0.530~0.988)。携带mi R-300 rs12894467 TT基因型发生原发性肺癌是携带CC基因型的0.689倍(95%CI:0.472~0.987)。3.按病理类型分层分析结果显示:携带IKBKAP rs2230793CC基因型患其他类型肺癌的风险是AA基因型的2.29倍(95%CI:1.03~5.08),是AA+AC基因型的2.48倍(95%CI:1.13~5.47)。携带CXCL12rs1804429 GT基因型发生肺腺癌的风险是携带TT基因型的0.64倍(95%CI:0.41~0.99),是携带GG+TT基因型的0.64倍(95%CI:0.42~0.99)。mi R-300 rs12894467携带TT基因型发生其他类型肺癌的风险是携带CC基因型的0.33倍(95%CI:0.12~0.95);携带CT基因型发生肺鳞癌的风险是携带CC基因型0.46倍(95%CI:0.22~0.97)。4.按是否吸烟或被动吸烟分层分析结果显示:在吸烟或被动吸烟人群中,NFKBIA rs1050851携带CT发生原发性肺癌的风险是携带CC的0.487倍(95%CI:0.266~0.892);携带CT发生原发性肺癌的风险是携带CC+TT的0.511倍(95%CI:0.279~0.935)。IKBKAP rs2230793携带CC发生原发性肺癌的风险是携带AA的1.676倍(95%CI:1.080~2.601),是携带AA+AC基因型的1.697倍(95%CI:1.104~2.608)。在无吸烟人群中,携带mi R-300rs12894467TT基因型患肺癌的风险是CC+CT基因型的0.650倍(95%CI:0.428~0.987)。5.IKBKAP单体型与肺癌发病风险分析结果显示:单体型TA携带者的肺癌风险是CT携带者的0.862倍(95%CI:0.753~0.987)。[结论]1.福建地区原发性肺癌的主要危险因素有:吸烟包年数、被动吸烟指数、家附近有污染企业、烹饪油烟、BMI<18.5。主要的保护因素有:BMI≥24、体育锻炼、散步、每周生吃大蒜>2次。2.携带NFKBIA rs8904 TT,rs1050851 CT,IKBKAP rs1538660 TT,CXCL12rs1804429 GT、mi R-300 rs12894467 TT基因型患肺癌的风险降低。携带IKBKAP rs2230793 CC基因型患肺癌的风险增加。3.IKBKAP r1538660、rs3204145单体型TA携带者的肺癌患病风险较CT携带者低。
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