【摘 要】
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目的:对牛肾上腺髓质肽8-22(BAM8-22:Val-Gly-Arg-Pro-Glu-Trp-Trp-Met-Asp-Tyr-Gln-Lys-Arg-Tyr-Gly)进行首次空间结构的研究,并进一步结合已有的生物活性数据从三维结构水
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目的:对牛肾上腺髓质肽8-22(BAM8-22:Val-Gly-Arg-Pro-Glu-Trp-Trp-Met-Asp-Tyr-Gln-Lys-Arg-Tyr-Gly)进行首次空间结构的研究,并进一步结合已有的生物活性数据从三维结构水平上分析BAM8-22及其一系列片段肽的构效关系。
方法:首先通过二维核磁共振技术测定了BAM8-22在水溶液中的空间三维构象,然后再通过20 ns的水中分子动力学模拟补充观察BAMS-22的动力学特征；接着,在BAM8-22核磁结构的基础上,对其片段肽BAM13-22,BAM15-22,BAM8-18,BAM8-20分别进行20 ns的水中分子动力学模拟,分析观察它们的结构变化与稳定性。结果:水溶液中的BAM8-22在肽段BAM12-20是一个相对稳定的α-螺旋结构,两端氨基酸残基是一个比较柔性的构象；而其片段肽BAM13-22的α-螺旋大约稳定在BAM15-20；BAM15-22的α-螺旋完全消失；BAM8-18的α-螺旋大约稳定在BAM12-16；BAM8-20的α-螺旋大约稳定在BAM12-18。结论:通过得到的BAM8-22的溶液三维结构与动力学特征及其片段肽的空间构象的变化信息,再结合已有的功能活性数据进行构效关系分析发现BAM12-20位的α-螺旋对维持BAM8-22的生物活性是非常必需的。所有这些结构研究,不仅能够指导合理改造BAM8-22,进而设计活性更好的类似物,同时也能给进一步研究BAM8-22与Mrg受体的相互作用机制提供结构基础。
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