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鸡白痢是一种严重威胁现代家禽养殖业的细菌性疾病,该病不仅可造成雏鸡的大规模死亡,同时隐性感染使得感染鸡生长迟缓、生产性状降低等,从而给养殖业造成重大的经济损失。养殖场主要疫苗接种和添加抗生素等药物的方法对其进行防治,同时也造成了致病菌耐药升高和禽产品抗生素残留等问题。随着研究的不断深入,人们发现鸡白痢的发生与个体的遗传因素相关。已有研究表明,NRAMP1、TLR4及MHC等基因多态性与抗鸡白痢沙门氏菌性状相关联。MyD88基因作为先天免疫通路中的一种重要的衔接蛋白,在免疫应答反应中发挥着重要作用。但是MyD88基因的多态性与鸡白痢疾病的关系却尚未见报道。为了探究鸡MyD88基因的多态性和鸡白痢沙门氏菌易感性之间的关联性分析。本试验基于病例-对照试验设计,以二郎山山地鸡为试验材料,采集阳性鸡样本血样128份,阴性鸡血样156份,共284份血样提取全基因组DNA,采用制作DNA池进行直接测序的方法筛选MyD88基因CDS区的变异位点,然后对采集的所有样本进行直接测序来检测MyD88基因CDS区的单核苷酸多态性,并进行基因分型,最后使用SPASS21.0软件和Hploview 4.2软件分别进行等位基因频率和基因型频率分析、单倍型组构建和单倍型分析。结果发现：通过对目的片段测序,在第5外显子501bp的片段中一共发现8个SNP,其中7个SNP为已知的SNP,一个是新发现的SNP,为SNP8(G1116T)。并且只有SN-P1(c.934C>T)的等位基因频率在患病-对照组中差异显著(P<0.05), SNP1 (c.934C>T)、SNP3 (c.1001G>T)两个突变位点的基因型频率在病例-对照组中的差异显著(P<0.05); SNP1 (c.934C>T)> SNP3 (c.1001G>T)、SNP4 (c.1010 T>C)位点构成的单倍型在鸡白痢病例-对照组中差异极显著(P<0.01)；同时,SNP5 (c.1020G>A)、SNP6 (c.1037G>C)、SNP7 (c.1096A>G)、SNP8 (c.1116 G>T)位点的单倍型与抗鸡白痢性状的差异不显著(P>0.05)。以上结果表明：鸡的MyD88基因的单核苷酸多态性与抗鸡白痢沙门氏菌的性状显著相关,可以作为一种抗鸡白痢性状的分子标记,为优质鸡的辅助标记选择提供一定的理论基础。