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随着我国城市化进程的加快，如何能保证城市系统的健康、活力、有序成为关注的焦点，生态城市相关的研究也成为课题研究的热点，本文结合能值分析手段，对城市复合生态系统做了详细的分析描述。能值理论是20世纪80年代后期美国生态学家Odum依据系统生态学的基本原理和方法提出的，它以太阳能值为统一尺度，解决了不同类型能量之间无法进行核算的问题，为复合生态系统的定量分析研究开拓了新途径。能值分析方法可同时定量研究生态经济系统中环境资源与经济活动的真实价值，因而对合理评估区域经济发展水平、制订正确的社会经济发展对策具有十分重要的意义。
本文以能值为基准，定量分析南京市复合生态系统的物流、能流、人口流等基本生态流以及货币流，编制了基本能值流表，并建立完善了相应的城市生态系统指标体系，首次使用了“系统开放程度”和“农业产出利用比”指标，分别对社会—经济—环境三个子系统做了的评价分析，并对国内外相关研究中存在的不足作了分析总结，期望能为以后的相关研究提供了方法上的借鉴和结果上的参考。
在与其他国家和地区相应指标进行比较分析的基础上，解读了南京市资源环境及经济发展状况。结果表明，2000-2004年南京市的人均能值为2.54×1016 sej，远高于江苏省2000年的水平：反映经济发展强度的“能值密度”五年间增长了1.6倍，2004年达到2.91×1019sej/Km2；购入能值比率高于国内同类城市，特别是燃料能值的购进比例大。与此同时，能值/货币比率从2000年的8.95×1012sej/$降到2004年的7.42×1012sej/$，表明南京地区城市化、工业化进程导致了资源利用效率的迅速提高，但和国外其它城市相比还有一定的差距。南京市的进出口能值基本保持平衡，比率在1.08左右；南京系统开放程度保持在0.4左右，小于90年代广州的平均水平0.6；同时，南京市的废弃物能值指标逐年下降，但能值负载率高，可持续发展指标逐年下降，理论上表明南京市可持续发展面临着挑战。
能值指标动态变化趋势表明，南京市资源形势日益严峻。在目前形势下，应充分发挥南京技术优势，调整产品结构，减少技术含量低的产品的生产量，多生产科技含量高、附加值高而能耗低的产品，实施资源的优化配置和集约利用，提高资源利用效率；调整出口商品结构，提高出口商品的技术含量；在能源的利用上要“开源节流”；积极控制人口增长，降低人口负荷，改善消费结构及消费方式，建立资源节约型的社会生产和消费体系；同时在城市化、工业化进程中实施严格的耕地资源保护措施，同时扎实做好节能管理工作。