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随着工业化进程的加快，各地工业园区不断涌现，在给人类带来物质产品极大丰富和社会经济高速发展的同时，也加剧了生态环境的不断恶化和不可再生资源的迅速耗竭。生态工业园是一种新兴的工业组织模式，它通过物质、能量和信息等的交换，形成园区各成员相互受益的网络，从而构成一个相互依存、协调共生的工业生态系统，最大限度地利用资源并减少对环境的负面影响，实现经济发展和环境保护的“双赢”。发达国家上世纪90年代就开始了生态工业园区的规划建设，我国继第一代经济技术开发区、第二代高新技术产业开发区之后，也正在积极地进行第三代生态工业园区的建设。但是目前国内不同类型、规模的工业园数量繁多，生态化建设条件参差不齐，如何对众多的工业园实行系统的建设管理、促使工业园向生态工业园成功转型，是管理部门面临的一大问题。
本文在系统梳理生态工业园建设管理方法的基础上，对生态工业园建设管理方法进行了系统的研究，并根据我国生态工业园管理的实际需求，构建了一套实用的方法：在企业层面，采用专家推理系统以及模糊综合评价法构建了企业入园筛选系统，构建了基于GIS的企业选址分析程序化方法，利用灰色关联度分析法创建了清洁生产审计企业筛选系统，并以CCR绩效评价模型为内核、绩效评价函数与环境调控函数为工具、建立了工业园企业环境绩效管理系统；在园区层面，首先考虑基础设施生态化的需求，构建了基础设施改进需求评价指标体系，建立了基础设施运作管理程序系统，同时将景观生态学的研究方法运用到园区生态景观建设中，并与目前生态工业园绩效管理方法融合，构建了生态工业园绩效管理系统。
此外，本文结合最新的计算机web技术以及GIS、RS等技术，深入研究和探索了决策支持系统的开发应用，并将生态工业园建设管理方法的研究成果用于决策支持系统的开发，设计出功能较为全面的生态工业园决策支持系统，最后以南通农药工业园为案例进行了系统展示。