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随着经济全球化与知识全球化不断深入,创新日渐成为区域经济增长的动力和源泉,而创新效率的高低则成为区域构建竞争优势的关键影响要素。现阶段,中国进入创新驱动发展战略施行的攻坚期,要想实现从科技大国跨越到科技强国的目标,在加大创新要素投入的同时,优化资源配置、提高创新效率是必经之路。依据2016年5月国务院发布的《长江三角洲城市群发展规划》,长三角城市群作为中国创新发展的前沿阵地,26个城市在区域创新能力提升和实现高质量发展中起着中流砥柱的作用。从创新地理研究来看,区域创新系统被认为是区域创新发展的关键,但对于区域创新系统运转效率的定量评价研究相对不足,对于区域创新效率的关键影响因素及其作用机理的认识尚无定论,急需进一步深入研究。在此背景下,本文选取长三角城市群26个城市为研究区域,通过构建区域创新系统创新效率模型,辨析各创新主体、创新环境对区域创新效率的影响及其作用机理,以期为加快世界级城市群建设、提升创新资源的空间配置效益提供参考。本文在总结区域创新系统理论、创新效率理论的基础上,以长三角城市群2008-2016年间的创新投入、产出为数据源,首先,选用DEA和变异系数对长三角城市群创新综合效率、纯技术效率和规模效率的时空演变特点进行了分析。此外为探究技术进步的作用,引入Malmquist分析方法,对长三角城市群创新全要素生产率及其分解指数的时空演变规律展开探讨;其次,借助固定效应面板Tobit模型识别了区域创新系统中创新主体与创新环境分别对长三角城市群创新综合效率的影响;最后,得出了本文的研究结论并提出相应政策建议,阐述了今后需要进一步研究的问题。本文研究发现:(1)长三角城市群创新规模效率>纯技术效率>综合效率;研究期内长三角城市群创新的综合效率、纯技术效率、规模效率均呈波动性增强状态,综合效率地区差异性最大,纯技术效率次之,规模效率区域差异性最小,其中纯技术效率是制约着整个长三角城市群创新综合效率提升的核心因素。(2)长三角城市群创新的综合效率、纯技术效率与规模效率高值区主要布局于沪宁合杭甬发展带的中心城市、节点城市及其辐射范围内的市域;创新规模报酬的空间分异变化明显,在研究末期规模报酬递增的市域数量最多,其显著集中于南京都市圈及其外围地带,呈现“大集中-小分散”的空间分布特点。(3)长三角城市群全要素生产率的增长依靠综合效率变动与技术进步变动“双轨驱动”,其中市域出现全要素生产率负增长是受综合效率阻滞的缘故,而市域出现全要素生产率为正增长的原因存在差异,主要有综合效率推动型、技术进步推动型以及综合效率与技术进步共推型。(4)长三角城市群创新技术进步变动指数的高值区依托上海为核心,以南京、杭州、宁波为节点城市呈现“Z”字型格局,全要素生产率的增长区则主要沿沪汉蓉高速铁路、沪杭甬高速公路布局,而综合效率变动指数、纯技术效率变动指数、规模效率变动指数的高值区空间分布较为随机。(5)金融深度、贸易专业化程度、区域经济发展水平对长三角城市群创新综合效率提升作用不显著;政府支持力度、创新人力资本、工业化水平对长三角城市群创新综合效率增强产生显著正效应;企业研发投入对长三角城市群创新综合效率增强产生显著负效应,正是这些因素的变化引致长三角城市群市域间综合效率的横向差异与纵向变化。