陕西饲养林麝群体线粒体DNA控制区的遗传多样性研究

来源 :北京林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wenhonghe
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林麝(Moschus berezovskii)人工饲养繁育始于上世纪50年代末,历经60多年的不懈努力,近20年饲养种群呈现较快的增长,然而,饲养林麝种群的遗传多样性现状及遗传结构尚缺乏充分的研究,因而不利于种群遗传管理及其饲养种群种质保护与利用。本研究从陕西省宝鸡市凤县的逢春麝场、片仔癀麝场、达吉康麝场、留凤关海兴麝场以及汉中市留坝县的太子岭麝场采集365份新鲜的粪便样品,用分子生物学方法扩增林麝线粒体DNA控制区基因序列。结果表明,在5个林麝繁育基地共检测到105个变异位点,包括单一性位点和简约信息位点,突变形式为转换和颠换,未出现插入和缺失现象。4种核苷酸(A、T、G、C)的平均含量分别为30.54%、31.21%、16.35%和21.90%,A+T的含量显著高于G+C。这说明林麝线粒体DNA控制区序列中A和T核苷酸的含量较多,证明碱基构成的偏倚性。通过分析143条序列的核苷酸差异,检测到43个单倍型,饲养林麝种群的核苷酸多样度和单倍型多样度分别为0.0380,0.9595,单倍型多样性以片仔癀麝场最高,为0.9555,留坝群体最低,为0.8000。邻接分子系统进化树和中介单倍网络图均可以将所有单倍型分为3簇,但单倍型分布混乱,这可能是由于不同群体个体间核苷酸分歧水平较低造成。AMOVA分子差异分析表明群体间的变异为8.04%,群体内的变异为91.96%,说明5个群体绝大部分遗传变异发生在群体内而非群体间。饲养种群间出现显著的遗传分化,其中,留坝群体与留凤关群体间的遗传分化指数FST(0.1875)最大,已达到高度分化。而达吉康群体与片仔癀群体间的遗传分化指数FST(0.0048)最小,为低度分化。其他群体间的遗传分化指数均在0.05~0.15之间,为中度分化。总体而言,饲养林麝种群较之众多濒危有蹄类饲养种群的遗传多样性高,但林麝饲养种群之间基因交流较少,建议实施基于非损伤取样的粪便mt DNA分析技术对群体内和群体间进行遗传管理,保护饲养林麝种群现有的遗传多样性。
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