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目的：剖析脑卒中康复住院医疗费用结构特点及合理性；探索脑卒中康复住院费用和功能进展的主要影响因素，建立以功能相关分类（FRGs）为基础的脑卒中康复住院费用和康复效果病例组合模型，探讨质量和费用相结合的FRGs支付办法，为制定科学的康复医疗保险支付办法及医疗卫生体制改革提供理论依据和参考标准。
方法：选取南京市l家三级医院和l家二家级医院2004年10月-2009年4月脑卒中康复医疗患者（896例）的康复治疗信息、出院病案首页和与病案首页相对应的住院费川明细清单，建立数据库进行回顾性分析。首先，对住院费川根据物价冈素进行适当调整。其次，运用描述性统计方法对脑卒中康复住院费用构成进行分析：再次，采用单因素、多冈素分析法探讨脑卒中康复住院费用及功能进展效果的主要影响因素；最后，应用决策树CHAID算法建立以功能相关分类(FRGs)为基础的脑卒中康复住院费用和康复效果病例组合模裂，在病例组合指数(CMI)思想的基础上，探索建立质量和费用相结合的FRGs支付办法。
结果：1、脑卒中康复住院费用构成中康复治疗费古38％，药品费古28％，检查费、化验费和放射费三项费用构成不足5％；2、脑卒中康复住院费用的主要影响因素为住院大数、入院时ADL分值、工作状况、并发症个数和支付方式；3、脑卒中患者功能进展的主要影响冈素为入院时ADL分值、首次卒中距今发病时间、职业和年龄；4、建立5个脑卒中康复住院费用FRGs组别；5、建立7个脑卒中康复效果FRGs组别：6、提出建立费用和质量相结合的FRGs支付办法的思想；7、给出医疗机构费用补偿公式。
结论：1、脑卒中康复住院费用结构与临床其它疾病的住院医疗费用结构有着明显区别，但药品比重依然很高，费用结构尚不合理；2、患者入院时功能状况（入院时ADL分值）是康复住院费用和患者功能进展效果的主要影响冈素，建立康复住院费用支付办法时应考虑和体现患者的功能及其进展情况；3、建立功能相关分类(FRGs)病例组合对康复住院费用预测良好，同时能实现康复医疗质量评价功能，但目前实施FRGs支付办法尚缺乏一定的必要条件。