七种青凤蝶的线粒体基因组全序列及其系统学意义

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青凤蝶属(Graphium)隶属于鳞翅目(Lepidoptera),凤蝶科(Papilionoidea),凤蝶亚科(Papilioninae),青凤蝶族(Leptocircini)。可分为五个亚属:青凤蝶亚属(Graphium)、纹凤蝶亚属(Paranticopsis)、绿凤蝶亚属(Pathysa)、剑凤蝶亚属(Pazala)及奥利斯比亚属(Arisbe)。世界范围内,该属蝶类共约100种,其中,青凤蝶亚属蝴蝶约30多种,其中我国有7种,绿凤蝶亚属共15种,纹凤蝶亚属共11种,剑凤蝶亚属共7种,奥利斯比亚属约30种。迄今为止,有关青凤蝶属的系统分类以及起源和进化方面的研究还比较匮乏,还有待于进一步的深入研究,特别是分子生物学数据资料和其他相关证据的介入。  本研究以及推测青凤蝶属起源和分化的路径图和时间表,利用PCR和long-PCR相结合的方法测定了国内7种青凤蝶(青凤蝶、统帅青凤蝶、碎斑青凤蝶、黎氏青凤蝶、木兰青凤蝶、银钩青凤蝶和宽带青凤蝶)的线粒体基因组全序列或近全序列;同时,结合GenBank中已有的凤蝶科线粒体基因组全序列数据,基于13个蛋白编码基因(PCGs)序列数据重建凤蝶科主要类群的系统发生树,并重点探讨7种青凤蝶的系统发生关系;基于已有的凤蝶科及其寄主植物的相关化石记录资料,运用宽松分子钟手段,推测青凤蝶属相关类群的分歧时间和进化路线图,以期为青凤蝶属及各亚属的分子进化和谱系发生方面的研究提供一些基础资料。实验结果显示:青凤蝶、统帅青凤蝶、碎斑青凤蝶、黎氏青凤蝶、木兰青凤蝶、银钩青凤蝶线粒体基因组全长分别为15299 bp,15377 bp,15235 bp,15213 bp,15169 bp,15212 bp,已测宽带青凤蝶近线粒体基因组序列长度为14540 bp,七种青凤蝶的线粒体基因组中均包含13个PCGs、2个rRNA基因、22个tRNA基因以及非编码的AT富集区。其中宽带青凤蝶的12S rRNA和tRNAMet基因序列不完整,而AT富集区未测出。这七种青凤蝶的PCGs的起始密码子除COI为CGA外,其它均为ATN;终止密码子除COI和COII基因是单个碱基T外,其余的均为TAA或TAG,编码的氨基酸数目分别为3727,3724,3728,3728,3726,3727,3728个。七种青凤蝶线粒体基因组中相邻基因或多或少存在重叠区或间隔区,重叠区长度范围为1~12 bp,间隔区长度范围为1~40 bp。除宽带青凤蝶外其余六种青凤蝶的控制区中 AT含量都是整个线粒体基因组中最高的,均达到94%以上。基于线粒体基因组全序列数据的凤蝶科主要类群间的最大似然树和贝叶斯树均显示,凤蝶科内各族之间的系统发生关系为(凤蝶族+裳凤蝶族+喙凤蝶族+青凤蝶族+(锯凤蝶族+绢蝶族);青凤蝶族内部,燕风蝶先分离出来,其次是铁木剑凤蝶;七种青凤蝶形成二个互为姊妹群的进化支,其系统发生关系为(((青凤蝶+宽带青凤蝶)+统帅青凤蝶)+(碎斑青凤蝶+木兰青凤蝶+银钩青凤蝶+黎氏青凤蝶)。基于已知的COI和ND5基因序列重建的青凤蝶属系统发生树显示,本研究所涉及七种青凤蝶的系统发生关系与上述结果一致;并推测绿凤蝶亚属、纹凤蝶亚属及青凤蝶亚属都是多系起源,而剑凤蝶亚属和奥利斯比亚属为单系起源。谱系发育年代学分析结果显示:凤蝶科的分歧时间是在86.8百万年前(Ma)的晚白垩纪时期(95%置信区间:70.6~106.1 Ma;下同);凤蝶亚科和绢蝶亚科的分化时间也都是在白垩纪晚期,分别为77.6 Ma(63.4~94.3 Ma)和72.0 Ma(48.8~95.4 Ma);青凤蝶族的分歧时间在第三纪古新世(61.9 Ma;47.1~79.9Ma);青凤蝶属的分化时间在第三纪始新世(43.66 Ma;29.61~51.0 Ma)。
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