【摘 要】
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研究目的:乳糜泻是由麸质引起的慢性自身免疫性肠病,临床表现可累及全身多个器官及组织,目前有效的治疗方案仅有去除麸质饮食。本研究首先通过对近10年与乳糜泻治疗相关文献进行计量学分析,探索该领域国内外研究现状,了解目前治疗研究热点及前沿,希望为临床医师及研究人员提供参考;其次采用多种生物信息学分析工具进行数据挖掘,筛选与乳糜泻发生发展相关的信号通路、枢纽基因及免疫细胞,为寻找更多的乳糜泻治疗靶点提供理
【基金项目】
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国家重点研发计划项目“2型糖尿病智能优化综合管理体系和社会经济效益评价”(NO.2018YFC1314100); 广东省自然科学基金项目(NO.2018A0303130118);
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研究目的:乳糜泻是由麸质引起的慢性自身免疫性肠病,临床表现可累及全身多个器官及组织,目前有效的治疗方案仅有去除麸质饮食。本研究首先通过对近10年与乳糜泻治疗相关文献进行计量学分析,探索该领域国内外研究现状,了解目前治疗研究热点及前沿,希望为临床医师及研究人员提供参考;其次采用多种生物信息学分析工具进行数据挖掘,筛选与乳糜泻发生发展相关的信号通路、枢纽基因及免疫细胞,为寻找更多的乳糜泻治疗靶点提供理论依据。研究方法:检索Web of Science核心合集,对2010-2019年乳糜泻治疗相关文献的年代分布及趋势和期刊分布进行统计分析,运用Vosviewer软件进行国家/地区合著分析、机构合著分析、作者合著及共被引分析、文献共被引分析以及关键词共现分析,并绘制相应合作网络图谱,使用Citespace软件对关键词进行突现分析。选取GEO和Array Expression数据库中的GSE72625和GSE112102数据集,筛选出差异表达基因,运用DAVID、Metascape及Kobas进行GO富集分析及KEGG通路分析,通过STRING数据库构建基因相关的PPI网络,使用Cytoscape插件筛选前20名枢纽基因,利用LncACTdb网站构建枢纽基因的ceRNA网络,利用ImmuCellAI进行免疫细胞浸润情况分析,最后基于SPSS软件对枢纽基因及免疫细胞进行Spearman相关分析。研究结果:1、共检索除乳糜泻治疗相关文献1289篇,发文量最多的期刊是Nutrients,该领域研究中占据主导地位是美国及欧洲等发达国家/地区,作者间合作次数最多的是Maki,M和Kaukinen,K。2、关键词共现及突现分析提示无麸质饮食的优化改良和重视患者身心健康是当前治疗的关键,酶补充治疗、免疫抑制疗法及肠道屏障修复成为乳糜泻治疗最新研究热点,难治性乳糜泻、肠道相关性T细胞淋巴瘤、1型糖尿病、自身免疫性甲状腺炎等并发症及合并症的治疗仍然具有挑战性。3、共筛选出82个差异表达基因,上调基因GO及KEGG富集分析结果为免疫反应和氧化应激,下调基因富集分析结果主要为营养物质转运吸收代谢过程。4、通过构建PPI网络得到了前20名枢纽基因主要参与:免疫反应、γ-干扰素反应、肿瘤坏死因子反应、脂质代谢过程、重金属离子反应。5、根据枢纽基因构建的CeRNA及进一步验证发现hsa-miR223-3p和hsa-miR491-3p调控ABCB1基因在乳糜泻中表达降低,是潜在治疗靶点之一。6、乳糜泻发病是以Th1/Th17细胞上调为主的促炎反应过程,与STAT1、CXCL10、GBP1、OAS2等上调基因密切相关,抑制上调基因相关通路及抑制促炎反应将成为未来研究乳糜泻辅助治疗的关键。研究结论:全球乳糜泻治疗研究领域现况主要包括无麸质饮食的优化改良、酶补充疗法、免疫调节、肠屏障修复。未来乳糜泻潜在治疗靶点主要集中在枢纽基因涉及的生物学过程及信号通路上,包括STAT1、CXCL10、APOB、ABCB1等。
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