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试验以三个蓖麻品种为材料，设置低温15℃、适温25℃（对照）进行生理指标测定及发芽力分析，并选取抗寒性较强的品种进行转录组测序分析，结果如下： 在低温条件下三个品种的可溶性蛋白质含量、丙二醛含量、SOD活性以及‘通蓖6号’、‘通蓖11号’的可溶性糖含量均成上升趋势，而三个品种的POD活性、CAT活性和‘通蓖5号’的可溶性糖含量呈下降趋势，三个品种的耐低温萌发能力依次是‘通蓖5号’>‘通蓖6号’>‘通蓖11号’，所以选取表现良好的‘通蓖5号’进行转录组测序。 试验对各样品之间进行差异分析，得到了1530个差异基因，其中低温相对于适温上调表达848个，下调表达682个。对差异表达基因进行了GO功能分类，其中生物学过程中主要聚集在生物合成过程、细胞过程和代谢过程；细胞组分主要聚集在细胞器、细胞成分中；而分子功能则主要聚集在酶活性和离子结合两个分类中。 对差异表达基因进行KEGG Pathway富集分析，显著富集的通路有植物激素信号转导（ko04075）、淀粉和蔗糖代谢（ko00500）、黄酮类化合物生物合成（ko00941）和苯丙素生物合成（ko00940）等，本试验中发现在细胞周期（ko04110）、DNA复制（ko03030）、细胞周期-酵母（ko04111）和减数分裂-酵母（ko04113）等通路中也有显著富集。 对差异表达基因进行转录因子家族分类，结果有ERF、bZIP、MYB、WRKY、C3H和NAC等33个不同的家族，其中有大部分是已经报道的在植物低温胁迫过程中应答的转录因子。 利用RT-qPCR对选取的8个差异表达基因进行了定量验证，其结果与转录组中的表达趋势一致，说明转录组的分析结果准确可信。