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目的了解我国南方地区常见致病性非结核分枝杆菌的流行状况;分析该地区非结核分枝杆菌对药物的敏感性;阐明非结核分枝杆菌的遗传多态性,以期为临床用药提供参考。方法1、2012年1月和2014年12月间,对从位于中国南部的广州胸科医院和东南部的上海肺科医院搜集的1571株非结核分枝杆菌临床分离株,应用16S rRNA、rpoB、hsp65和ITS多靶位基因PCR-测序的方法对经硝基苯甲酸(PNB)初步鉴定为非结核分枝杆菌的临床分离株的分子菌种鉴定。2、采用微孔板显色法检测非结核分枝杆菌对20种药物的最低抑菌浓度(MIC)。3、应用可变串联重复序列基因分型方法对鸟分枝杆菌、胞内分枝杆菌和脓肿分枝杆菌复合群进行基因分型,采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性分析对堪萨斯分枝杆菌进行基因分型。4、研究非结核分枝杆菌基因型与表型的相互关系。结果1、鉴定结果为非结核分枝杆菌的菌株总共1450株,最常见的是脓肿分枝杆菌,占23.7%,其次是马赛分枝杆菌和胞内分枝杆菌,分别占17.9%和17.3%。2、鸟分枝杆菌对阿米卡星的敏感性最高(87.8%),对替加环素的耐药率最高(100%);胞内分枝杆菌对克拉霉素的敏感性最高(88.6%),对替加环素、亚胺培南和美罗培南的耐药率最高(100%);堪萨斯分枝杆菌对阿米卡星的敏感性最高(94.9%),对替加环素的耐药率最高(97.4%);脓肿分枝杆菌对阿米卡星的敏感性最高(93.1%),对利福平的耐药率最高(100%);马赛分枝杆菌对阿米卡星的敏感性最高(89.0%),对链霉素和亚胺培南的耐药率最高(98.8%)。鸟分枝杆菌对利奈唑胺、美罗培南、亚胺培南、头孢西丁、加替沙星和新诺明的敏感性高于胞内分枝杆菌,差异具有统计学意义(P<0.05);脓肿分枝杆菌对莫西沙星,加替沙星,新诺明和替加环素的敏感性较高,而对米诺环素的敏感性低于马赛分枝杆菌,差异具有统计学意义(P<0.05)。3、鸟、胞内、脓肿和马赛分枝杆菌的VNTR各位点呈现出不同的等位基因多态性,分辨率指数在0.933-0.999之间,成簇率分别为29.3%、36.4%、13.8%和27.0%。堪萨斯分枝杆菌经聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性共得到4个不同的亚型,其中亚型Ⅰ是最常见的基因型,占71.8%。4、鸟分枝杆菌中,卷曲霉素、阿奇霉素、左氧氟沙星、链霉素、美罗培南和头孢西丁在成簇菌株中的耐药率高于非成簇菌株,差异无统计学意义(P>0.05);胞内分枝杆菌未成簇菌株对左氧氟沙星的耐药率(96.4%)显著高于成簇菌株(81.3%)(P<0.05);脓肿分枝杆菌未成簇菌株对头孢西丁的耐药率(28.2%)显著高于成簇菌株(10.0%)(P<0.05);马赛分枝杆菌未成簇菌株对米诺环素的耐药率(54.6%)显著高于成簇菌株(40.9%)(P<0.05);26.8%的堪萨斯分枝杆菌亚型Ⅰ对克拉霉素耐药。结论我国南方地区非结核分枝杆菌菌种种类多,共分离出12种,最常见的5种分离株分别是脓肿分枝杆菌复合群、鸟胞内分枝杆菌复合群、戈登分枝杆菌、堪萨斯分枝杆菌和偶发分枝杆菌。不同的菌种对药物敏感性差异较大,成簇菌株与未成簇菌株对药物的敏感性也不同,因此,准确的菌种鉴定、基因分型和药敏试验对指导NTM肺病的临床治疗具有重要的参考依据。