人源氧化固醇结合蛋白ORP3-ORD结构域的结构与功能研究

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nlqysb
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
脂类转运蛋白(Lipid transfer protein,LTP)是一类定位在细胞质中的蛋白,可以结合脂类分子,并在细胞器的膜之间行使转运功能。由LTP负责的细胞器之间脂类转运,是细胞内脂类转运的三种方式之一,是一种高特异性,高效率的转运方式。脂类的三种运输方式为:自由扩散,通过脂类转运蛋白辅助运输和囊泡途径的运输。  固醇类和磷脂类组成了细胞内的膜系统,通过维持这两种脂类不同的比例,来保证不同细胞器的分隔和特定的功能。LTP转运脂类的方式在真核细胞内广泛存在,运输的脂类包括了固醇类和磷脂类中的多种类型。所有的LTP都有标志性的脂类结合口袋,用一个疏水的空腔装载脂类,有些LTP还有其他的功能结构域,赋予LTP复杂多样的功能。在1980年发现的氧化固醇结合蛋白(Oxysterol binding protein,ORP)是一类LTP蛋白,最初鉴定出对氧化固醇有高的亲和力,随后的研究发现将ORP的转运范围扩大到磷脂类,目前已在多种真核生物中发现ORP蛋白。有些ORP只有一个结合脂类结构域(OSBP-related domain,ORD),有些还有其他结构域,使ORP蛋白可以富集在膜结合位点(Membrane contact site,MCS)高效地转运脂类,此外ORP还有着维持脂类稳态和细胞内信号传递等多种功能。各种ORP蛋白转运的特定脂类一直是一个研究热点,尤其在人源ORP中,除了OSBP鉴定出胆固醇和25-羟基胆固醇的结合能力,其他ORP的脂类结合性质鲜有研究,而对于人源ORP蛋白脂类结合结构域的结构研究是一个空白。  ORP3是一个定位在内质网和质膜间的人源ORP蛋白,除了ORD结构域还有结合PI4P的PH结构域和结合VAP蛋白的FFAT模式等。本研究报道了首个分辨率2.1(A)的人源ORP-ORD晶体结构,以及分辨率3.2(A)的ORP3-ORD与磷脂酰肌醇4磷酸(PI4P)的复合物晶体结构。通过对结构的分析,发现ORP3-ORD与之前报道的酵母Osh蛋白的三级结构较为相似,表明ORP蛋白家族高度的保守性。蛋白结合PI4P后主链并未发生大的构象变化,仅盖子区域发生了少量位移。在ORP3-ORD的结构中可以清晰地看到结合口袋上方的盖子结构,结构分析后我们认为盖子区域能发生的构象变化范围有限,与PI4P复合物结构比对的结果验证了我们的结论。分析复合物结构发现了三处保守残基构成的正电簇,将PI4P的磷酸肌醇头部固定在口袋的靠近开口处,与apo结构的比对分析发现与结合磷酸头部相关的残基,通过侧链的构象变化使得口袋内的正电性变强了。通过等温滴定定量热实验(ITC)测定了ORP3-ORD与PI4P的解离常数,证实了两者有较强的结合能力。序列比对结果显示结合PI4P头部的残基在人源ORP中也是保守的,因此我们推测PI4P也是人源ORP的共同结合脂类。ORP3-ORD结合口袋的构象十分牢固,不会发生大的形变,口袋的形状决定了能结合的脂类种类,而ORP3-ORD的空腔形状不适合固醇类和长链酰基的磷脂。我们在实验中未能得到固醇类与蛋白的复合物晶体,经过模拟发现空腔内多个侧链挤占了固醇的结合空间,因此我们推测ORP3-ORD不结合固醇类。有研究报道ORP3会与R-Ras相互作用影响细胞的粘附和迁移,而ORP3结合的特定脂类还是未知的,对ORP3-ORD结构的解析为寻找它转运的特定脂类,以及功能研究带来一些启示。
其他文献
Sigma-Delta调制器是Sigma-Delta ADC核心功能原件,采用过采样技术和噪声整形技术提高了转换精度和有效量化位数,应用十分广泛。工业测试Sigma-Delta ADC需要借助高精度的测
环境污染问题实际上是多种污染物共存引起的复合污染。多元体系复合污染条件下的交互作用,特别是有机与无机污染物复合污染,使得污染物在土壤中的环境行为、联合生态毒性效应及
识别自身抗原(髓鞘碱性蛋白)的CD4+T细胞大量的迁移到中枢神经系统(central nervous system,CNS)是引起多发性硬化症(Multiple Sclerosis,MS)发生的关键因素。寻找调控T细胞浸润C
肿瘤的转移和复发是导致肿瘤病人死亡的主要原因。Snail作为调节表皮间充质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的重要转录因子,与肿瘤的生长、转移侵袭及复发都密切相
系统性红斑狼疮(Systemic Lupus Erythematosus,SLE)是一种以具有多种临床症状表现为特征的自身免疫性疾病。狼疮肾炎(Lupus Nephritis,LN)是SLE中最严重的并发症之一。目前普
A型流感病毒M2蛋白(A/M2)在病毒囊膜上以四聚体形式存在,分子间二硫键将四个M2分子围成一个质子通道,该通道介导的酸化是诱发HA变构及病毒vRNP释放的前提条件。A/M2相对最长的
近年来,随着微电子机械系统(MEMS)设计与制造技术的日趋成熟,各种MEMS陀螺仪应运而生,它们有着传统机械式陀螺仪无法企及的体积小、重量轻、功耗低、成本低等优点,使得陀螺仪
学位
由于抗生素所具有的应用和商业价值,改造其制备工艺、提高产量一直是抗生素的研究重点。本论文依据材料的不同分为两部分内容。   第一部分是对青霉素扩环酶的改造,以期提高
学位
作物生长模型的研制依赖于单点田间实验研究,当其被应用到区域尺度时,由于生态和水文过程的尺度依赖性,模型的模拟可靠性会受到挑战。利用大田、实验室和遥感等多源数据优化模型