拟南芥谷氨酰-tRNA还原酶及其调控蛋白GluBP和FLU的结构与功能研究

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wy19841010
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在植物、藻类和多数细菌中,卟啉的合成始于由谷氨酰-tRNA还原酶催化的NADPH对Glu-tRNA的还原。谷氨酰-tRNA还原酶是卟啉合成途径的第一个酶、关键限速酶及多种翻译后调控的靶位点。血红素对GluTR有反馈抑制作用;FLU在黑暗条件下可以抑制ALA的合成,且与GluTR相互作用;GluBP是新发现与GluTR相互作用蛋白,其参与将GluTR分配到叶绿体的不同亚区域,最终将产物ALA分配到血红素合成通路中。  我们通过结构生物学手段得到了拟南芥GluTR-GluBP蛋白复合物的晶体结构。GluTR-GluBP蛋白复合物的晶体结构显示GluBP以对称二体的形式通过C端结构域与V形结构的二体GluTR的催化结构域相互作用。GluTR的NADPH结合结构域发生旋转,证实了NADPH结合结构域旋转并还原底物的假设。Arg146位于代谢通道出口出且有两个构型,可能既与底物识别有关又与产物释放有关。GluTR的活性分析表明,GluBP可以将GluTR的活性提高到约为原来的3倍,因为ALA合成增加了3倍左右。另外,不管有没有GluBP,血红素可以抑制GluTR的活性;但在GluBP存在的情况下,抑制到同等的活性水平需要更高浓度的血红素。结构比对显示GluBP是一个HugZ结构同源蛋白,但是GluBP的N端结构域与HugZ的C端结构域相似,而GluBP的C端结构域与HugZ的N端结构域相似。  FLU通过C端的TPR结构域与GluTR的C端相互作用。GluTR的C端结构域的完整性是GluTR与FLU相互作用的基础。GluTR的C端22个氨基酸是高等植物中特有的。缺失C端22个氨基酸的GluTR可以形成二体并与GluBP相互作用,但是不能与FLU相互作用。GluTR、FLU与GluBP在体外可以形成稳定的复合物。FLU对GluTR的负调控是有条件的,但是FLU与GluTR的相互作用无需特殊条件。体外活性实验表明FLU与GluTR的相互作用并不影响GluTR的活性,而且GluBP也可以促进FLU-GluTR复合物中GluTR的活性,这与体外孵育三者可形成稳定的复合物是一致的。另外,血红素可以抑制FLU-GluTR复合物中GluTR的活性,这说明血红素和FLU对GluTR的调控是两个独立的过程。FLU与GluBP分别和GluTR的C端与N端相互作用,而FLU和GluBP分别是负正调控因子。我们推测在光下FLU将GluTR及GluBP分配到叶绿素合成途径中;在黑暗条件下由于某些因素FLU影响GluTR的C端结构,从而达到抑制GluTR活性的效果。  另外,我们得到高纯度的GluTR-GluBP-FLU三元复合物蛋白,并进行了结晶条件筛选及优化,获得了分辨率为3.8(A)的数据。但尚不能解出结构,晶体在进一步优化。  
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