ICOS mir-SNP与结直肠癌发生发展及其机制的初步研究

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lxm1230520
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本文对ICOS miR--SNP与结直肠癌发生发展及其机制进行了研究。本研究分为两个部分:  第一部分:ICOS miR-SNP与结直肠癌发生发展的相关性研究。  目的:探讨ICOS基因3-UTR内的miR-SNP与结直肠癌发生发展的相关性。  方法:⑴运用生物信息学软件筛选出位于ICOS基因3-UTR内的SNP位点及可能存在的miRNA结合位点;选择位于预测的miRNA结合位点内的,且较小等位基因频率(MAF)大于10%的SNP进行研究。⑵收集382例结直肠癌患者及714例正常人的外周血样本,从中提取DNA,通过高通量SNP基因分型来检测SNP的基因型分布。⑶分析不同基因型与结直肠癌发生发展及临床病理参数的关系。  结果:①从SNP数据库中找到符合条件的SNP有:rs10183087、rs4404254、rs1559931和rs4675379;能与之结合的miRNA分别有:rs10183087位点位于miR-587和miR-3180-5p的结合靶点内;rs4404254位点位于miR-186-5p、miR-520d-5p、miR-524-5p、 miR-548b-3p、miR-1276和miR-3133的结合靶点内;rs1559931位点位于miR-587、miR-1279和miR-3692-3p的结合靶点内;rs4675379位点位于miR-182-3p、miR-323b-5p、miR-2117、miR-2355-3p和miR-4279的结合靶点内。②成功检测到基因型分布的SNP有:rs4404254T>C,rs1559931G>A和rs4675379 G>C。③数据分析显示,在结直肠癌患者中, rs4404254的CC型纯合子所占比例明显低于占主导地位的TT型纯合子(0.8% vs2.1%;OR=0.35),而TC杂合子(21.3%vs27.6%; OR=0.70)和C等位基因携带者(22.1% vs29.7%; OR=0.58)所占比例同样明显低于TT型纯合子。rs1559931的AA纯合子所占比例明显低于占主导地位的GG型纯合子(1.1% vs2.2%;OR=0.46),而GA杂合子(21.0% vs27.2%; OR=0.70)和A等位基因携带者(22.1% vs29.4%; OR=0.60)所占比例明显低于GG型纯合子。与GG纯合子相较,rs4675379的A等位基因携带者在患者组中明显少见(18.0% vs22.0%; OR=0.66)。ICOS miR-SNPs与结直肠癌的临床病理参数间无相关性。  结论:SNP位点rs4404254、rs1559931和rs4675379与结直肠癌的发生显著相关,其C等位基因,A等位基因和C等位基因可能是结直肠癌的保护性因素。  第二部分:ICOS miR-SNP对ICOS表达调控机制的研究。  目的:研究ICOS基因3-UTR上的SNP位点对miRNA的调控作用。  方法:⑴构建野生型ICOS/3-UTR/pGL3重组荧光素酶表达载体和突变型ICOS/3-UTR/pGL3重组荧光素酶表达载体:(rs4404254 CC型、rs1559931AA型和rs4675379 CC型)。⑵将构建好的载体和各自相对应miRNA共同转染CHO细胞,并用双荧光素酶报告系统测定基因活性。⑶运用统计学软件分析各SNP位点对miRNA的调控作用。⑷通过western blot进一步验证miR-SNP对于miRNA的调控作用。  结果:rs4404254 T等位基因特异性的ICOS/3-UTR/pGL3载体的表达被miR-186-5p显著抑制(p=0.0072)。rs1559931G等位基因特异性的ICOS/3-UTR/pGL3载体的表达能被miR-1279(p=0.0026)和miR-3692-3p(p=0.0023)显著抑制。rs4675379 C等位基因特异性的ICOS/3-UTR/pGL3载体的表达能被miR-323b-5p(p=8.27×105)显著抑制;而rs4675379 G等位基因特异性的ICOS/3-UTR/pGL3载体的表达能被miR-2117(p=0.03)显著抑制。  结论:ICOS基因3-UTR内的SNP位点rs4404254 T>C,rs1559931G>A和rs4675379 G>C在一定程度上可通过由miR-186-5p,miR-323b-5p,miR-1279,miR-2117和miR-3692-3p介导的调控机制来影响ICOS分子的表达,从而改变结直肠癌的易感性。
其他文献
目的:梗阻性黄疸(以下简称梗黄)的治疗一直是外科一大难题。尽管麻醉水平、手术技术等有了很大提高,但其术后并发症发生率和死亡率并无明显降低。研究发现,肠道细菌和内毒素移位
目的 探讨护理防治对提升助产质量和防治产后出血的作用.方法 选择2017年2月到2018年2月来我们医院进行诊治的120例住院分娩的病人进行研究,并把全部病人平均分成研究组和对
讨论了具有不确定性时滞及仿射结构不确定系统的简易自适应控制问题 .给出了对系统再建模方法 ,所提出的方法可更精确评价不确定性时滞 .通过对受控对象附加鲁棒并行补偿器补
采用不同地域的16个样品.分离脱胶菌148株,其中麻田土获脱胶菌105株,获得率居首位(35%).复选后60h完成亚麻脱胶的有9株,占所分离脱胶菌的6.1%;72h完成亚麻脱胶的19株,占所分离脱胶菌的12.8%,5株60h完成脱胶的菌株性能测定
粒重是小麦籽粒产量的决定因素之一,是灌浆速率和灌浆持续期(以下简称灌浆期—译者)的函数。目前尚缺乏有关灌浆速率及灌浆期的遗传方面的资料。本研究旨在确定灌浆参数的配合力
对细胞质分别来源于粘果山羊草(Ae.kotschyi)、偏凸山羊草(Ae.ventricosa)、提莫菲维(T.timopheevi)的3种普通小麦雄性不育系,其相应保持系和共有的一种恢复系的mtDNA进行了RFLP比较分析。发现K型和V型不育系的mtDNA在组织结构上不同于T型,说
海水淹溺型肺水肿(PE-SWD)是指由于海水淹溺所引起的肺内水含量较正常增多的一种病理改变。其最主要的病理生理改变是缺氧。PE-SWD如早期得不到及时救治,可形成急性肺损伤(ALI
傅绍万,1957年7月出生,中共党员。1982年8月中国人民大学新闻系毕业分配至大众日报社工作,先后任大众日报社总编室编辑、副主任,机动记者组副组长,总编辑助理、理论部主任,党
目的:通过对孕晚期孕妇不同人群B族链球菌(GBS)培养及药敏试验,并追踪其妊娠结局,探讨不同人群中的孕晚期孕妇GBS阳性率异同以及与妊娠结局相关性和危害性,为针对性地进行预防和
全文分为二部分 第一部分 异氟醚预处理对大鼠海马脑片缺氧无粮损伤的影响 目的:利用离体海马脑片电生理技术和碘化丙啶荧光染色技术研究异氟醚(isoflurane,Iso)单次和