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本文对ICOS miR--SNP与结直肠癌发生发展及其机制进行了研究。本研究分为两个部分: 第一部分:ICOS miR-SNP与结直肠癌发生发展的相关性研究。 目的:探讨ICOS基因3-UTR内的miR-SNP与结直肠癌发生发展的相关性。 方法:⑴运用生物信息学软件筛选出位于ICOS基因3-UTR内的SNP位点及可能存在的miRNA结合位点;选择位于预测的miRNA结合位点内的,且较小等位基因频率(MAF)大于10%的SNP进行研究。⑵收集382例结直肠癌患者及714例正常人的外周血样本,从中提取DNA,通过高通量SNP基因分型来检测SNP的基因型分布。⑶分析不同基因型与结直肠癌发生发展及临床病理参数的关系。 结果:①从SNP数据库中找到符合条件的SNP有:rs10183087、rs4404254、rs1559931和rs4675379;能与之结合的miRNA分别有:rs10183087位点位于miR-587和miR-3180-5p的结合靶点内;rs4404254位点位于miR-186-5p、miR-520d-5p、miR-524-5p、 miR-548b-3p、miR-1276和miR-3133的结合靶点内;rs1559931位点位于miR-587、miR-1279和miR-3692-3p的结合靶点内;rs4675379位点位于miR-182-3p、miR-323b-5p、miR-2117、miR-2355-3p和miR-4279的结合靶点内。②成功检测到基因型分布的SNP有:rs4404254T>C,rs1559931G>A和rs4675379 G>C。③数据分析显示,在结直肠癌患者中, rs4404254的CC型纯合子所占比例明显低于占主导地位的TT型纯合子(0.8% vs2.1%;OR=0.35),而TC杂合子(21.3%vs27.6%; OR=0.70)和C等位基因携带者(22.1% vs29.7%; OR=0.58)所占比例同样明显低于TT型纯合子。rs1559931的AA纯合子所占比例明显低于占主导地位的GG型纯合子(1.1% vs2.2%;OR=0.46),而GA杂合子(21.0% vs27.2%; OR=0.70)和A等位基因携带者(22.1% vs29.4%; OR=0.60)所占比例明显低于GG型纯合子。与GG纯合子相较,rs4675379的A等位基因携带者在患者组中明显少见(18.0% vs22.0%; OR=0.66)。ICOS miR-SNPs与结直肠癌的临床病理参数间无相关性。 结论:SNP位点rs4404254、rs1559931和rs4675379与结直肠癌的发生显著相关,其C等位基因,A等位基因和C等位基因可能是结直肠癌的保护性因素。 第二部分:ICOS miR-SNP对ICOS表达调控机制的研究。 目的:研究ICOS基因3-UTR上的SNP位点对miRNA的调控作用。 方法:⑴构建野生型ICOS/3-UTR/pGL3重组荧光素酶表达载体和突变型ICOS/3-UTR/pGL3重组荧光素酶表达载体:(rs4404254 CC型、rs1559931AA型和rs4675379 CC型)。⑵将构建好的载体和各自相对应miRNA共同转染CHO细胞,并用双荧光素酶报告系统测定基因活性。⑶运用统计学软件分析各SNP位点对miRNA的调控作用。⑷通过western blot进一步验证miR-SNP对于miRNA的调控作用。 结果:rs4404254 T等位基因特异性的ICOS/3-UTR/pGL3载体的表达被miR-186-5p显著抑制(p=0.0072)。rs1559931G等位基因特异性的ICOS/3-UTR/pGL3载体的表达能被miR-1279(p=0.0026)和miR-3692-3p(p=0.0023)显著抑制。rs4675379 C等位基因特异性的ICOS/3-UTR/pGL3载体的表达能被miR-323b-5p(p=8.27×105)显著抑制;而rs4675379 G等位基因特异性的ICOS/3-UTR/pGL3载体的表达能被miR-2117(p=0.03)显著抑制。 结论:ICOS基因3-UTR内的SNP位点rs4404254 T>C,rs1559931G>A和rs4675379 G>C在一定程度上可通过由miR-186-5p,miR-323b-5p,miR-1279,miR-2117和miR-3692-3p介导的调控机制来影响ICOS分子的表达,从而改变结直肠癌的易感性。