【摘 要】
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乳制品是新疆地区游牧民族生活中必不可少的饮食,其制作过程离不开乳酸菌的发酵,对新疆地区乳制品中乳酸菌多样性的研究,为乳酸菌资源的开发利用提供了理论基础。本研究基于Pacbio SMRT测序技术和乳酸菌特异性引物,对采集自新疆地区的93份乳制品中乳酸菌的菌群结构进行解析,从一定程度上揭示了新疆地区乳制品中乳酸菌多样性。分析结果显示:（1）从整体来看,新疆地区乳制品中乳酸菌的优势菌种为Lactobac
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乳制品是新疆地区游牧民族生活中必不可少的饮食,其制作过程离不开乳酸菌的发酵,对新疆地区乳制品中乳酸菌多样性的研究,为乳酸菌资源的开发利用提供了理论基础。本研究基于Pacbio SMRT测序技术和乳酸菌特异性引物,对采集自新疆地区的93份乳制品中乳酸菌的菌群结构进行解析,从一定程度上揭示了新疆地区乳制品中乳酸菌多样性。分析结果显示:（1）从整体来看,新疆地区乳制品中乳酸菌的优势菌种为Lactobacillus helveticus、Lactobacillus delbrueckii、Streptococcus thermophilus、Lactococcus lactis、Lactobacillus kefiranofaciens和Lactococcus laudensis,但不同乳制品的乳酸菌菌群结构间存在差异。（2）基于Uni Frac距离的UPGMA聚类可将93份乳制品划分为4个分类群（cluster）,4个cluster的α多样性差异显著,cluster1仅包含3个以Lactococcus为优势乳酸菌菌属的乳制品,优势乳酸菌菌种为Lactococcus lactis、Lactococcus laudensis、Lactococcus raffinolactis、Lactobacillus helveticus和Streptococcus thermophilus,其余cluster均以Lactobacillus为优势乳酸菌菌属;cluster2和cluster3中的乳制品主要为酸牛奶,且几乎包含了93份乳制品中所有酸牛奶,其中,cluster2的优势乳酸菌菌种为Streptococcus thermophilus、Lactobacillus delbrueckii、Lactobacillus helveticus和Lactococcus lactis,cluster3的优势乳酸菌菌种为Lactobacillus delbrueckii、Lactobacillus helveticus和Streptococcus thermophilus;cluster4中的乳制品则均为马奶制品,优势乳酸菌菌种为Lactobacillus helveticus、Lactobacillus kefiranofaciens、Lactococcus lactis、Streptococcus thermophilus、Lactobacillus delbrueckii、Enterococcus faecalis、Lactobacillus kefiri和Lactobacillus pontis;另外,基于分类群的菌群分析使大量低丰度乳酸菌菌种被发现。（3）4个cluster间的差异乳酸菌菌种分析显示,Lactococcus lactis、Lactococcus raffinolactis和Enterococcus faecium在cluster1中的相对含量显著高于其他cluster,Lactobacillus leichmannii、Streptococcus thermophilus和Streptococcus salivarius在cluster2中的相对含量显著高于其他cluster,Lactobacillus helveticus和Lactobacillus delbrueckii在cluster3中的相对含量显著高于其他cluster,Lactococcus garvieae、Lactobacillus helveticus、Lactobacillus kefiranofaciens、Lactobacillus kefiri、Lactobacillus pontis和Lactobacillus parakefiri在cluster4中的相对含量显著高于其他cluster;且差异菌种间存在显著相关关系。对新疆地区乳制品中乳酸菌多样性的研究为乳酸菌资源的开发利用提供了理论基础。
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