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在小鼠胚胎发育早期，多能性的上胚层经过原肠运动，形成外中内三个胚层。这三个胚层是体内所有器官和组织发育的基础来源。相对于中内胚层已有较多的研究，也都建立了类似的中内胚层干细胞，外胚层的研究却大部分都是空白。外胚层的概念已提出多年，然而到目前为止，外胚层分化和发育的内部机制仍然所知甚少，外胚层的命运决定和模式建成并不清楚。因此，首先我们在体内通过分化和诱导实验，确立了外胚层存在的位置与时期。进一步，为了详细考察外胚层决定过程中的分子机制，我们建了在小鼠胚胎上的激光显微切割以及单细胞测序等技术，在全基因组水平上考察和分析了外胚层的转录表达图谱。通过这样的分析手段，我们得到了外胚层发育阶段的全胚胎转录组分子表达情况，也鉴定出了与外胚层发育相对应的特异基因表达模块。同时，我们也在体外建立了外胚层干细胞系，可以模拟和代表体内外胚层的发育特征。结合体内体外的实验手段，深入研究原肠运动过程中外胚层命运决定的重要分子机制，在全基因组水平上详细阐释了外胚层模式建成的分子调控。