VHL基因突变与非突变肾透明细胞癌microRNA芯片研究

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肾细胞癌约占成人恶性肿瘤的3%,在泌尿系统恶性肿瘤中致死率最高。在散发型肾透明细胞癌和希佩尔-林道(VHL)病中,VHL作为肿瘤抑制基因常常突变和失活。VHL基因的信使RNA可以编码一种含有213个氨基酸的蛋白pVHL,其分子量约为24-30kDa。VHL蛋白具有多种重要功能,都与抑制肿瘤发生相关。其抑癌作用中研究最为清楚、证据最为充分的是VHL蛋白可以通过泛素化降解缺氧诱导因子(HIF)抑制肾细胞癌的发生。   微小核糖核酸(microRNA)是一种非编码小RNA,其可以在转录后水平调节基因的表达,调节多种肿瘤细胞的生物学行为。当今芯片技术是基因学研究中的重要方法。通过微点阵芯片(microarray)我们可以同时检测上千种基因的表达。以往研究中常用的是全基因组芯片,其可以检测全部信使RNA的表达情况。现在一种新的芯片技术,microRNA芯片技术已经被广泛采用。近5年,有30余篇肿瘤学研究采用了这种技术。这些研究寻找到了潜在的在肾透明细胞癌与癌旁正常组织以及不同病理类型肾细胞癌microRNA表达的差异。鉴于VHL基因和microRNAs在肾细胞癌尤其是肾透明细胞癌发生过程中的重要且广泛作用,本研究试图通过microRNA芯片技术寻找到VHL相关性microRNAs。   材料和方法:   收集187例散发型未转移肾透明细胞癌组织标本,提取全基因组DNA并进行PCR扩增后,运用DNA测序技术,分析肾透明细胞癌VHL基因突变状态。从中选取无突变以及有意义突变(包括移码突变、无义突变、启动子点突变)各8例,经western-blot印记法在蛋白水平上验证VHL的变化后。送LC公司进行microarray分析,后进行聚类分析。   实验结果:   1.在散发型肾透明细胞癌中,VHL基因外显子的突变率为56.1%。同时,我们发现了一系列数据库尚未报道的突变,其中包含两种可以造成VHL蛋白延长的突变。   2.芯片结果发现了40个具有明显表达差异的miRNA,其中25个miRNA与肿瘤学研究紧密相关。   结论:发现了一系列VHL基因相关miRNA
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