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对于中国传统医学思想的研究，多指它在战国时期形成基本框架以来而论。然而在先秦时代的不同历史阶段，社会中都存在着关于疾病医疗问题的观念，这些观念为何种形态，与后来的中国传统医学思想又存在何种关系值得探讨。这些问题不止从属于中国医学本体发展的内部逻辑，从更广泛的思想史角度考察，传统医学思想实是通过与中国先秦时代以来各类思想观念长期互动脱胎而来。这些思想史上的历程与变化问题也应为历史学者所关注。 本论文基于这样的考虑，尝试还原先秦时代自商代后期至战国末叶社会中关于疾病、治疗等问题认知的细节，兼而辨析中国传统医学思想中一些重要观念、理论和认知的起源及流变经过。 本文第一章由古史传说入手，引入对中国古代医学起源问题的讨论，考证古史传说折射出中国医学在早期某阶段的形态，并论断其时代背景因素。 在第二至四章中，依照历史发展的年代顺序纵向展开，进行断代研究。文章由甲骨材料至传世文献再到简帛文书，依次展现由商代后期至西周初年，而后至春秋、再至战国各个时期不同国族中有关疾病的认识与相应的治疗活动，描绘多样的历史风貌，并深入探究其背后的思想动因，并揭示几类重要疾病观念的发展变化脉络。文章重点讨论了商人的疾病占卜系统结构，以探究时人的疾病观念，由此证明贯穿先秦时代疾病观念中祖先崇拜与鬼魂恐惧两大要素的起源。春秋后期至战国时代作为新旧疾病观念的交替和并存的时期，外在的治疗形式与相应的医学观念都存在相当的复杂性，文章对其中的情况作出了细节性的探讨。第四章中重点论述了医学思想中的理性观念自春秋中后期萌芽后的发展与演变情况，并由巫医职业的分途与并用阐明不同疾病观念的共存状况。 第五章与第六章是相对独立的两种专题研究。第五章着重讨论中国早期医学观念与政治思想的互动关系，指出二者间存在强烈的双向影响，并最终形成了趋向一致的譬喻结构。第六章以简帛材料与文献资料的互证为例，专注于五行观念进入医学思想体系后的一则特殊演变历程，显示出脱胎于中国古代思想体系的医学观念通过不断结合进步中的临床医学知识，最终走向具有学科独立逻辑性的发展之路。 依照上述考察的结果，本文认为，早期疾病观念中具有祖先崇拜与超自然思维的强烈特点，它们在先秦时代始终存在，但在春秋中后期理性化的医学思想出现之后，前者的位置逐渐被边缘化，最终并未在医学思想体系中占据一席之地。与此同时，以之作为观念背景的一些治疗术则由于传统习惯延续的力量在后世继续存在，甚至以几乎未曾改变的形式出现于晚近的文献材料中。早期医学观念在春秋后期至战国时代的逐步理性化过程中，与当时的哲学和政治思想发生了强烈互动，从中借用了许多概念作为自身理论的核心观念，同时也对当时的政治社会等思想产生明显的反馈作用。当这些本源于哲学政治等思想的观念被纳入医学思想体系之后，它们逐渐结合了大量来自临床实践的医学理论，被赋予了新的阐释，并在此基础上建立了传统医学思想特有的逻辑结构。这些与先秦时代哲学及政治理论同源而出的思想观念自此又按照具有医学学科特色的路径持续发展。