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本文研究了转基因棉花的环境安全性，首先研究转Bt基因棉对土壤无脊椎动物及非目标昆虫的影响，与常规棉比较，转基因棉降低了非目标昆虫及土壤无脊椎动物的多样性、均匀性，增加了优势集中性，使非目标昆虫的生态系统和土壤无脊椎动物的生态系统的稳定性受到了降低，并且降低了士壤无脊椎动物及非目标昆虫的种类和数量。其次，采用ELISA的方法，对转基因棉花的基因漂移进行了研究，叶片毒蛋白的ELISA分析表明：基因漂移距离约50米，主要有东、南、西三个方向，说明棉花基因漂移主要受昆虫传播的影响。第三，比较棉花发育的三个时期(现蕾期、花铃期、衰老期)距根系不同距离土壤微生物数量、总糖含量、氨基氮含量，结果表明，抗虫棉在现蕾期土壤中总糖、氨基氮含量依三个距离基本持平，花铃期和衰老期的糖、氨基氮含量依三个距离呈上升趋势；常规棉在现蕾期糖、氨基氮含量依距离呈上升趋势，花铃期先下降后上升，衰老期呈下降趋势。微生物的数量变化趋势，抗虫棉：三个时期微生物数量依距离均呈上升趋势；非抗虫棉：现蕾期呈上升趋势，花铃期先下降后上升，衰老期呈下降趋势。根据距根系不同距离土壤总糖、氨基氮和微生物数量的变化趋势表明，由于微生物的代谢作用，使得土壤中糖、氨基氮的含量发生了变化。但抗虫棉和非抗虫棉糖、氨基氮含量变化趋势的差异说明，由于抗虫棉的根系分泌物使微生物产生了避性，从而产生抗虫棉与非抗虫棉的根系周围土壤微生物的数量变化差异，进而导致糖、氨基氮含量随微生物数量变化的梯度差异。