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近年来,人们有意识地进行良种选育,对茶树(Camellia sinensis)进行大幅度地无性繁殖,使茶树种质资源向着单一化方向发展的趋势。因此,对茶树种质资源进行有效保护尤为重要。武陵山区具有极为丰富的茶树种质资源,做好当地茶树种质资源保护与利用工作,理清资源间的遗传关系,对茶树种质资源保护及种质资源库的建立具有重大意义。本研究借助ISSR (Inter-simple Sequence Repeats)分子标记技术对分布在武陵山区的183份茶树种质资源进行DNA水平上的研究,探讨供试材料之间亲缘关系与遗传多样性,为武陵山区茶树核心种质的保护及品种鉴定提供理论依据,同时,为武陵山区茶树的起源提供参考。主要研究结果和结论如下：1.在前人研究的基础上,对影响ISSR反应体系较大的dNTPs浓度、模板DNA浓度、引物浓度和Taq酶量等方面进行正交设计优化扩增体系,建立了适宜茶树的ISSR-PCR分析的反应体系。反应体系为：20μL反应体系中,Taq DNA聚合酶0.75U/μL,10×buffer(含Mg2+)2.0mmol·L-1,模板DNA20ng,dNTPO.1mmol·L-1,引物0.3μmol·L-1.反应程序为：94℃预变性5min,94℃变性1min,50℃-60℃退火40s,72℃延伸90s,34次循环,72℃延伸7min,4℃保存。该体系扩增出的条带清晰、稳定,可用于ISSR分析。2.从65ISSR引物筛选出28条多态性较高的引物,对183份茶树种质资源进行ISSR-PCR扩增。28条引物共扩增出340个条带,其中多态性带328条,多态性比率为96.47%。单个ISSR引物扩增的ISSR条带数在7-18条之间,平均每条引物扩增出12.14条多态性条带,多态性最高为100%,最低为87.5%。产物的大小介于100-2800bp之间。3.183份供试材料间的遗传距离系数较大,两两之间遗传相似性系数分布于0.52-0.93之间,说明武陵山区茶树种质资源存在较大的遗传变异性,遗传基础较宽。在这些茶树种质资源中,资源圃中的1号与2号的相似度最高,遗传相似系数最高为0.93,说明它们之间遗传差异很小4.在遗传相似性系数为0.64处,183份茶树种质资源被划分为两大类。第1类全部为资源圃中的资源,第1大类分为3个亚类。第Ⅱ大类分为7个亚类,其中2个为独立的类。5.依据ISSR分析结果,对供试的183份茶树种质资源进行聚类分析,并绘制了遗传关系树状图,揭示了武陵山区茶树资源之间遗传多样性与亲缘关系。树状图可以直观地反映出各资源间的遗传关系。6.构建了183份茶树种质资源的ISSR指纹图谱,利用ISSR的指纹可以清楚、快速的区分出这些茶树种质资源。