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疾病基因在复杂疾病过程中以协作的方式相互作用,这对于疾病的发生发展起关键作用。然而,如何分析及表示基因之间的关联关系仍然是一个问题。传统的方法并不能给出直接的生物学证据解释在复杂疾病发生过程中,疾病基因之间如何相互关联,由一组相互作用的生物学模块构成的分子网络为解决这一问题提供了希望。
本文基于疾病基因通过分子网络中的生物学模块间的相互作用相互关联这一假设,提出了一种新的疾病基因互作通路的表示和分析方法,并使用这种方法成功识别冠心病、高血压和2型糖尿病的疾病基因互作通路,这些通路分别包含46、87和123个疾病风险模块以及182、306和579个互作关系。分析结果显示,疾病基因是通过与疾病相关的生物学功能和通路相互关联的。
本文的分析结果证实了原始假设:复杂疾病的疾病基因以协作的方式与邻居基因互作,通过疾病风险模块间共享的生物学功能和通路相互关联,并最终引起分子网络中一系列生物学过程的功能障碍,从而导致疾病的发生。希望本文的方法可以用于识别其他复杂疾病的疾病基因互作通路,并以此为复杂疾病的发病机制提供更多的线索。