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企业所得税是我国重要的直接税税种，也是税收优惠政策的重要工具。我国的中小板和创业板上市公司中高新技术企业占80％以上，也是各类税收优惠的集中地。本文以我国扶持中小企业和高新技术产业的政策取向为研究背景，总结了新所得税法实施以来针对高新技术企业和研发投入的主要税收优惠政策，并运用中小板和创业板上市公司2008-2010年的年度数据，实证考察了企业微观特征和研发投入强度与企业所得税实际税负的关系，发现各地区企业的实际税负没有明显差异，而税收优惠的行业性导致不同行业企业间实际税负差异较大。在回归分析中，通过分离政策因素与企业个体因素的影响，本文发现企业的规模、盈利能力和融资决策等因素与政策因素，即企业享受的税率优惠没有明显关系，而是主要通过企业经营内容、组织形式等个体努力影响企业的实际税负。规模较大和盈利能力较强的企业承担了较高的实际税负;企业研发支出具有较强的节税作用，且其中费用化的比例对研发节税作用的强度有很大影响。