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视网膜色素变性(retinitis pigmentosa, RP)是常见的遗传性视网膜退化性疾病,全球范围内的发病率约为 1/3000-1/4000,临床主要表现为夜盲、进行性视野缺损和全盲。RP具有显著的临床和遗传异质性,根据遗传方式不同,主要可分为以下三种类型:常染色体显性视网膜色素变性(autosomal dominant RP, ADRP),常染色体隐性视网膜色素变性(autosomal recessive RP, ARRP)和X-连锁视网膜色素变性(X-lined RP, XLRP)。其中,症状较为严重的类型是XLRP,占所有单纯性RP的15%。在与XLRP相关的众多基因中,最主要且已成功定位克隆的是视网膜色素变性GTP酶调节因子(retinitis pigmentosa GTPase regulator, RPGR),又名RP3基因,位于Xp21.1,其编码蛋白RPGR参与视觉转化信号蛋白在感光细胞中的运输过程。有研究表明,RPGR基因的突变导致了临床上70%左右的XLRP病例。 本研究小组收集到一个XLRP家系,通过新一代测序技术(next generation sequencing, NGS )在X染色体的RPGR基因上发现一个新的突变c.494G>A (p.Gly165Asp),先证者为突变半合子。根据美国医学遗传学与基因组学学会(The American College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)发布的“遗传变异分类标准与指南”,将该突变归类为“疑似致病突变”(likely pathogenic)。通过家系成员的突变位点分析,先证者的女儿存在RPGR的c.494G>A杂合突变,即为XLRP携带者。由于先证者女儿计划生育二胎,经遗传咨询,在了解到后代存在XLRP患病风险后,选择胚胎植入前遗传学诊断(preimplantation genetic diagnosis, PGD)治疗,并签署知情同意书。本研究小组采用囊胚滋养外胚层细胞活检、单细胞全基因组扩增(whole genome amplification, WGA)及NGS平台,运用联合诊断单基因病和染色体病非整倍体高通量测序与连锁分析( mutated allele revealed by sequencing with aneuploidy and linkage analyses, MARSALA)新策略,成功地筛选出3个不携带RPGR突变的整倍体胚胎,移植1个胚胎后获临床妊娠,且于妊娠20周行羊膜腔穿刺产前诊断,胎儿染色体核型及RPGR突变分析结果与PGD结果完全一致,均未发现异常。 Leber先天性黑蒙(Leber congenital amaurosis, LCA)多属常染色体隐性遗传,仅少部分家系报道为常染色体显性遗传。LCA可导致婴幼儿早期即出现全盲症状,并伴有神经性耳聋、糖尿病、尿崩症等一系列并发症,是最严重的遗传性视网膜病变之一,全球发病率约为1/33000-1/81000。目前为止,通过连锁分析、基因定位等技术,已发现了25个LCA相关基因。本研究小组收集到一个LCA家系,通过NGS发现先证者存在LCA致病基因之一的IQCB1基因c.1090C>T纯合突变,为已报道的致病性突变。对先证者及其父母的相应突变位点采用Sanger测序做进一步验证,结果发现,先证者的父母均为c.1090C>T杂合突变,因此推断先证者的纯合突变分别来自父母。就诊时先证者母亲再次怀孕,经遗传咨询,该家系选择行产前诊断,并签署知情同意书。本小组提取先证者母亲羊水DNA标本,采用亲子鉴定实验评估母体基因组DNA污染,并通过PCR和直接测序对胎儿突变位点进行检测,发现其携带有与父母相同的c.1090C>T杂合突变。 Leber遗传性视神经病(Leber hereditary optic neuropathy, LHON)是线粒体DNA (mitochondrial DNA, mtDNA)突变引起的视神经萎缩,呈母系遗传,男性患者多见,全球患病率约为1/50000。临床主要表现为双眼无痛性的急性或亚急性中心视力下降,色觉受损等,通常在青少年时期发病。该病预后差,大部分患者最终失明。本研究小组收集到一个LHON家系,根据LHON原发性致病突变热点设计引物,对先证者及其家系中有相同症状的母亲和姐姐进行PCR及直接测序,发现三人均存在m.11778G>A的同质性热点突变。 综上所述,本研究小组首次将基于MARSALA的新PGD策略,即突变位点序列分析+SNP连锁分析+染色体非整倍体分析的联合诊断方法应用于XLRP,并获得满意的临床结局。结果提示该新方法能够明显改善XLRP等单基因遗传病的妊娠结局,值得在临床上推广应用。此外,本小组针对LCA建立的分子诊断及产前诊断方法和针对LHON建立的分子诊断方法可为先证者及其家系高危成员的遗传咨询、风险评估和后续生育计划提供可靠的科学依据。