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自主创新是当前区域经济发展的热点议题,提高自主创新能力已上升为我国地区乃至国家战略。在经济全球化和区域一体化背景下,地区自主创新能力不仅取决于区域研发创新投入的内源式创新,而且还取决于从其他地区获取技术研发外溢的程度。其中区际产业转移已成为我国地区尤其是欠发达地区获取外源性技术研发外溢的主要渠道,因而区际产业转移对自主创新的溢出效应是当前经济学研究中一个较为新颖的论题,自主创新效应也是我国实施产业转移过程中国家战略预期的关键之一。当前国内外有关产业转移对自主创新溢出效应的研究,更多的集中在以直接投资为主要载体的国际产业转移对东道国自主创新的影响,以及区际产业转移中自主创新的必要性、缺失原因等定性分析上。有关区际产业转移对地区自主创新影响的机理分析和经验性实证研究明显不足,尤其是针对我国特定区域,分析国内区际产业转移对自主创新溢出效应的理论和实证专题研究更是缺乏。因此,积极研究国内区际产业转移的自主创新效应,系统地探讨其作用机制及其影响因素,无疑具有重要的理论价值和现实意义。在梳理相关研究文献的基础上,本文按照区际产业转移对自主创新溢出的效应、区际产业转移对自主创新溢出的作用机制及其影响因素的研究思路展开理论研究,并运用安徽和重庆2004-2008年地区与行业层面的面板数据,实证检验区际产业转移对地区自主创新的影响。本文的主要研究内容与研究成果有以下方面：论文的数理研究中,本文通过运用数理模型,推导了区际产业转移对自主创新溢出的效应。(1)依据区际产业转移对自主创新溢出的主要影响方式,构建了区际产业转移自主创新效应的理论框架,提出技术研发溢出效应、技术直接转移效应和集聚效应三种创新效应,并进行了详细的论证。分析显示,本地学习吸收效率越高,区际产业转移的技术研发溢出效应越大；本地人力资本积累越快,技术直接转移效应促使本地技术创新越明显；区域产业集聚与本地自主创新呈倒U形的关系。(2)论证了区际产业转移对自主创新溢出的作用机制和影响因素,分析表明,区际产业转移创新效应的传导机制分为行业内水平溢出的四种创新机制和行业间垂直溢出的链接-创新机制,以及中间产品-创新机制和集聚-创新机制；分析表明区际产业转移的创新效应还受到地区层面的经济发展水平、人力资本存量、研发投入、经济开放度、基础设施和产业集聚因素以及行业层面的技术差距因素的影响。论文的实证研究中,本文分别从安徽和重庆地区与行业层面检验了区际产业转移对自主创新的溢出效应及其影响因素。(1)检验表明,在地区层面,区际产业转移对地区自主创新产生显著正向的溢出效应,验证了区际产业转移自主创新效应的存在性。分组回归结果进一步表明,这种创新溢出效应主要体现在一些技术水平相对较低的实用新型和外观设计专利方面,在技术水平相对较高的发明专利方面,区际产业转移的创新溢出效应不显著。而影响区际产业转移自主创新效应的因素研究表明,人力资本存量、研发支出、地区经济发展水平、基础设施和产业集聚程度对区际产业转移的自主创新效应产生显著正向的影响；地区经济开放度对区际产业转移创新溢出的影响不显著。(2)检验表明,在行业层面,区际产业转移对行业内自主创新产生显著正向的溢出效应,验证了行业内区际产业转移的自主创新效应的存在性。行业内影响因素的检验表明,两类企业适度的技术差距对区际产业转移的自主创新效应产生显著正向的影响。区际产业转移对行业间前后向产业自主创新产生显著正向的溢出效应,而且前向作用强度都要比后向大。上述检验进一步验证了区际产业转移中相关创新机制的存在性。在理论研究与实证分析基础上,本文得出了一些研究结论,同时,借鉴国际产业转移对创新溢出的相关经验和政策导向,提出中国区际产业转移对自主创新溢出效应的政策建议和策略选择。本文的可能创新之处在于：(1)扩展和丰富了区际产业转移与自主创新的关联理论,从地区和行业层面对区际产业转移的自主创新效应及其影响因素进行实证检验,一定程度上填补了该领域经验性实证的空白,揭示了区际产业转移与FDI作用强度的差异性。(2)从我国区际产业承接及其对自主创新溢出影响方式的视角分析中国区际产业转移对自主创新溢出的效应、影响因素和内在传导机理,这是一种重要的视角突破。(3)采用动态分析法、比较分析法和连乘交叉分析法等多种分析法,将区际产业转移的创新溢出效应、影响因素、两类企业互动程度等内涵纳入实证分析框架中,较全面系统地实证了区际产业转移的自主创新效应。