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经济由规模速度型粗放增长向质量效率型集约增长转变离不开企业内生动力的增强，只有作为微观主体的企业加大创新，才能推动产业结构优化升级。同时，信息经济时代竞争日益激烈的市场也需要企业通过研发创新谋求生存和长远发展，如何促进企业尤其是中小企业研发投资，成为学术领域和实务领域共同关注的焦点。本文以深圳证券交易所2011-2016年中小板上市公司为研究样本，对财务柔性与企业研发投资间的关系进行了理论分析和实证检验，并将环境不确定性作为调节变量纳入该研究框架，考察环境不确定性和财务柔性的交互作用对企业研发投资的影响，最后进一步将财务柔性细分为现金柔性和负债柔性，分别探讨现金柔性、负债柔性对研发投资的影响，分析环境不确定性对现金柔性与研发投资关系、负债柔性与研发投资关系在调节作用方面的异同。根据研究结果得出结论：财务柔性能促进企业研发投资，企业面临的不确定性程度越高，财务柔性对研发投资的促进作用越大；进一步地，现金柔性、负债柔性都能促进企业研发投资，但环境不确定性只对负债柔性和研发投资间的关系有显著的调节作用，不确定性程度越高，负债柔性对企业研发投资的促进作用越大，而环境不确定性对于现金柔性和研发投资关系的调节作用不显著。上述结论为中小企业创新实践提供了经验证据，具有一定的理论启示。