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高中化学新课程分为必修和选修模块。选修3《物质结构与性质》知识内容较抽象，是大学结构化学的下放。教师普遍反应知识点难教，教学中对学科思想方法的落实更是少。本研究是基于《物质结构与性质》第二章《分子结构与性质》所蕴含的学科思想方法展开研究的，探查对象是中学教师。本研究主要采用文献分析法、文本分析法以及访谈法。运用文献分析法对《分子结构与性质》的研究现状进行分析，发现研究主要是关于内容选编、内容难度跨越等的研究。基于此，通过对该部分内容的学科发展史进行梳理研究，提炼其核心的学科思想方法即模型方法和结构与性质研关系研究见微知著的方法。然后运用文本分析法对《分子结构与性质》中体现该方法的内容进行提炼。通过与专家和中学教师的访谈，发现教师在处理该部分内容时，主要依据教材进行介绍，虽对学科发展史有不同层次掌握，但在教学中强调知识的传授，对方法的应用强调机械记忆。对模型方法和结构与性质关系研究方法的认识教师存在不同的认知，但共性是认同思想方法在学生学习中的重要性。最后笔者基于访谈实录分析，进行访谈结论的归纳得出结论，并提出建议。